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空间学数据解析肿瘤微环境的异质图学习方法

该研究提出了名为stKeep的新模型。该模型构建了三种不同节点即细胞/spot、基因和肿瘤区域以及八种连接关系的异构图模型,用于刻画肿瘤微环境。

2024-07-02

Nat Med揭示儿童肥胖的‘脂’命密码:脂质学助力心脏代谢风险管理

本研究通过质谱分析对儿童和青少年的脂质谱进行分析,揭示了肥胖与多种脂质(如神经酰胺、磷脂酰乙醇胺等)的关联,并发现这些脂质与心脏代谢风险(如胰岛素抵抗、肝脂肪变性等)显著相关。

2024-09-23

Nature:新的基因记录技术使得活细胞能够记录自己的历史

ENGRAM将各种生物信号或事件与特定的符号条形码相联系,这一创新的记录手段是对先前分子记录技术的重要补充。

2024-07-24

Cell:科学家识别出与致癌基因改变发生相关的分子通路

本文研究结果揭示了中心DNA修复机制的病理性激活如何通过染色体破碎矛盾地诱发癌症基因组进化。

2024-09-15

Nature Genetics:赵方庆团队开发高通量三维空间转录新技术

MAGIC-seq提出了“拼接芯片”的概念,即通过调整网格间距和多轮编码的方式将多个捕获网格拼接在一起,突破了传统微流控方法的通道限制,实现了高分辨率与大视野的兼顾。

2024-09-13

JOR Spine:肠道微生物或会影响机体的脊柱健康

揭秘肠道如何影响脊柱健康

2024-10-24

科研人员开发基于深度学习模型的空间转录精细分辨率细胞注释算法

STASCAN提供了用于整合空间基因表达信息和组织学图像进行精细分辨率细胞注释的工具,在解码细胞空间精细分布和解析特异组织结构方面具有优势。

2024-11-10

Nat Microbiol:帕金森疾病药物或会在缺乏铁离子状况下促使肠道微生物功能恶化

本文研究揭示了两种尚未被研究的药物对机体整体微生物组的影响效应,并识别出了金属离子的隔离或许能作为药物诱导的微生物组紊乱的一种特殊机制。

2024-12-18

Nature :探索早期胚胎DNA复制,揭秘基因不稳定性与复制时间程序

该研究利用scRepli-seq技术构建小鼠早期胚胎的全基因组DNA复制图谱,并探究DNA复制调控机制与基因组稳定性的关系。

2024-10-09

研究揭示海洋巨型单细胞多核钙化藻基因异源多倍化与生物钙化机制

针对仙掌藻和脆叉节藻的钙化模式的差异,该研究揭示了仙掌藻胞外钙化和脆叉节藻次级细胞壁钙化的遗传调控特征。

2024-10-04