Cell Stem Cell丨Ivan Bedzhov 课题组揭示胚胎滞育调控新机制
本研究揭示了滞育胚胎在转录水平上是动态变化的。此外，上胚层细胞依靠Integrin感知外部微环境，并通过 Yap/Taz 介导的促生存信号来维持在滞育期间的存活。
2024-08-03
Nature Methods ：生物影像分析的未来！NanoPyx开启效率与智能的双赢时代
NanoPyx的核心技术——Liquid Engine，借助机器学习动态优化算法实现对多种硬件环境的自适应支持。它能够实时评估输入数据和硬件特性，自动选择最优的中央处理单元或图形处理单元加速策略。
2025-01-07
Cell Metabolism | 营养素影响胰岛素分泌的蛋白质组学密码
这项研究在人胰岛中确定了碳水化合物、蛋白质和脂质三种营养素的胰岛素分泌反应，搭建了在线数据平台：www.humanlislands.com作为胰岛深层表型网络资源。
2024-08-12
空间组学数据解析肿瘤微环境的异质图学习方法
该研究提出了名为stKeep的新模型。该模型构建了三种不同节点即细胞/spot、基因和肿瘤区域以及八种连接关系的异构图模型，用于刻画肿瘤微环境。
2024-07-02
Nature Methods：肿瘤进化的空间图谱，CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化
CalicoST算法的诞生填补了这一空白。它不仅能够从空间转录组数据中推断出肿瘤的等位基因特异性拷贝数变异，还能够重建肿瘤克隆在空间中的进化轨迹，绘制出肿瘤演化的“进化地图”。
2024-11-10
Nat Cell Biol：赵方庆团队开发基于编程控制的转录组实时测序新技术
该研究首次提出了转录组智能测序的概念，依托人工智能纳米孔自适应测序算法，能够实时判断测序分子来源，并可编程选择目标测序分子进行全长测序。
2024-11-03
Cell Stem Cell：隋鹏飞课题组揭示肺基底干细胞线粒体代谢调控新机制
本研究揭示了线粒体丙酮酸代谢在肺基底干细胞命运决定中的核心作用，构建了代谢与表观遗传的调控环路。这一发现为肺部疾病的治疗提供了新的思路。
2024-11-01
Mol Cell：HOXDeRNA 通过与基因组广泛结合激活癌症转录程序和超级增强子
HOXDeRNA通过rG4结构结合EZH2并招募到PRC2标记的基因组区域，从而去除PRC2对关键胶质瘤转录因子和超级增强子的抑制，最终激活多个癌症驱动基因，驱动星形胶质细胞向胶质瘤转化。
2024-11-07
Protein & Cell：冷泠课题组揭示皮肤类器官移植促进冻伤创面无瘢痕愈合
这项研究强调了皮肤类器官在冻伤期间的细胞命运调控、ECM重塑和皮肤功能恢复方面的重要作用，展现了类器官在促进冻伤损伤愈合和无瘢痕修复的巨大潜力，为冻伤导致的皮肤损伤患者提供了全新的治疗选择。
2024-11-01