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Science:对人类血细胞中的所有蛋白编码基因进行全基因转录组分析

2019年12月31日讯/生物谷BIOON/---在临床和研究环境中,血液都是对人类进行分子分析的主要来源,并且是许多治疗策略的目标,这突显了需要对构成人类血液的细胞进行全面的分子图谱构建。人类蛋白质图谱计划(www.proteinatlas.org)是一个开放式数据库,旨在通过整合各种组学技术(包括基于抗体的成像)来绘制所有人类蛋白的图谱。以前,人类蛋白质

2019-12-31

研究开发单细胞空间转录数据分析可视化平台

单细胞测序技术是一种在单细胞水平上对基因组、转录组、表观组等进行高通量测序分析的技术。单细胞测序技术能够在组学水平揭示细胞间的异质性。单细胞水平细胞谱系追踪技术位居2018年Science 杂志评选的十大科学突破之首。常规单细胞转录组测序技术丢失了细胞在原组织中至关重要的空间位置信息,而单细胞空间转录组技术在进行单细胞转录组测序的同时保留并记录了细胞的空间位置信息。空间转录组技术能够揭示细胞间的相

2019-11-16

中国科学家揭示乙肝病毒相关性肝癌的多维蛋白基因特征

 肝细胞癌(Hepatocellular Carcinoma,HCC)是全球第四大癌症死亡原因,占所有原发性肝脏恶性肿瘤的85%-90%。HCC诱发的主要原因包括乙型肝炎病毒(Hepatitis B Virus,HBV)和丙型肝炎病毒(Hepatitis C Virus,HCV)慢性感染、酗酒以及代谢综合征。其中,85%的中国HCC患者是由HBV感

2019-12-10

研究人员揭示RNA聚合酶在大肠杆菌细胞内的空间组织及其与转录的关系

  2019年9月16日,PNAS杂志在线发表了约翰霍普金斯大学医学院肖杰博士团队的研究成果,题为“Spatial organization of RNApolymerase and its relationship with transcription in Escherichia coli”。该工作揭示了RNA聚合酶(RNAP)簇的特征及其在细胞内空间分配模式不仅依赖于rR

2019-11-04

第十四届国际基因大会(ICG-14)正式开幕

2019年10月25日上午,第十四届国际基因组学大会(The 14th Annual Meeting of International Conference on Genomics,以下简称“ICG-14”)在深圳国家基因库正式开幕。来自全球的顶尖科学家和创新者齐聚深圳,他们将通过主题演讲、专题研讨和成果演示的方式,与ICG-14参会者们分享他们的成果与观点。国际基因组学大会是由华大主办的全球生命

2019-10-25

Science:利用单细胞基因进行人类细胞表型分析

2019年10月20日讯/生物谷BIOON/---在一篇近期发表在Science期刊上的标题为“Mapping human cell phenotypes to genotypes with single-cell genomics”的综述类型文章中,瑞士研究人员认为在了解构成人体的细胞表型和人类基因组如何被用来构建和维持每个细胞的目标中,我们正处在一个迷人的旅程中。瑞士巴塞尔分子与临床眼科研究所

2019-10-20

我国科学家实现单细胞表观新突破:两种革新单细胞ChIP-seq技术解码细胞命运决定机制

在国家重点研发计划“干细胞及转化”重点专项(批准号:2017YFA0103402)等资助下,北京大学分子医学研究所、北大-清华生命科学联合中心何爱彬课题组近期突破单细胞表观遗传研究的瓶颈,开发了两种具有普适性、操作简单、风格迥异的单细胞ChIP-seq技术,可适应于不同课题研究需要,解析发育与疾病状态下细胞命运决定调控机制。这两项技术分别于2019年8月27日在Molecular Cell和201

2019-10-03

Mol Bio Evo:基因研究揭示细菌抗生素耐药性如何在不同物种间传播

2019年9月18日 讯/生物谷BIOON/ --在最近一项研究中,来自克莱姆森大学的研究者们记录了人体内寄生菌所产生的抗生素耐药性基因向其它物种内寄生菌横向传播的趋势。每年都会有大量的人群患有各种人畜共患病,这些疾病通常通过食物,水或与动物直接接触传播,而直接导致疾病发生的病原菌则包括沙门氏菌,大肠杆菌,炭疽等。对此,研究员Richards认为,人类体内抗生素抗性基因的出现最有可能是由于过度使用

2019-09-19

Cell:利用蛋白质技术揭示转移性黑色素瘤患者为何对免疫疗法没有反应?

2019年9月16日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在国际杂志Cell上的研究报告中,来自特拉维夫大学的研究人员通过研究解释了为何超过一半的转移性黑色素瘤患者对癌症免疫疗法没有反应,文章中,研究人员利用蛋白质组学技术(蛋白质图谱绘制)回答了目前他们迫切想要知道的一个问题,即为何免疫疗法对黑色素瘤患者有很大帮助,但对60%的转移性黑色素瘤患者却没有影响。图片来源:Wikimedia C

2019-09-16

Nat Commu:从基因表达和代谢层次揭示疫苗引发免疫反应差异的原因

2019年8月17日讯 /生物谷BIOON /——沃尔特·里德陆军研究所(Walter Reed Army Institute of Research,WRAIR)领导的一个研究小组利用单细胞RNA测序和代谢谱技术,对疫苗诱导的T细胞免疫机制有了新的认识。尽管有许多疫苗可以诱导和扩增T细胞(机体适应性免疫系统的关键部分),但在决定T细胞反应的大小、多样性和持久性方面,科学家们对其中的细节还不清楚。

2019-08-17