Nature：利用单细胞转录组学揭示成神经管细胞瘤不同亚型的细胞组成
2019年7月28日讯/生物谷BIOON/---成神经管细胞瘤（medulloblastoma）是一种恶性儿童小脑肿瘤类型，包含不同的分子亚型。成神经管细胞瘤已被分为四种不同的分子亚型：WNT和SHH（均由它们的同名基因发生的突变驱动），组3和组4。组3和组4占所有成神经管细胞瘤病例的60％，但是也最少被人理解的。这部分上是因为当前没有在遗传上准确地模拟组4的实验室模型。此外，尽管这些亚型的基因组
宏基因组&代谢组学：两大组学共同揭示结肠直肠癌中肠道菌群的阶段特异性表型
近期，日本大阪大学 Shinichi Yachida 及其研究团队在医学著名期刊 Nature Medicine (IF=30.641)上发表题为“Metagenomic and metabolomic analyses reveal distinct stage-specific phenotypes of the gut microbiota in colorectal cance
6小时识别病原菌的纳米孔宏基因组学方案
近日，英国东安格利亚大学的Justin O'Grady博士和Earlham研究所的科学家成功开发了一种宏基因组学检测的研究方法。该优化后的研究方案针对细菌性下呼吸道感染，可从临床呼吸道样本中去除高达99.99％的宿主核酸，并利用纳米孔测序的实时检测在6小时内准确识别病原体和抗生素抗性基因。《Nature Biotechnology》杂志7月以封面文章的形式刊登了该项研究。细菌性下呼吸道
科学家利用大规模比较基因组学绘制A群链球菌候选疫苗图谱
近日，澳大利亚昆士兰大学等科研人员在Nature Genetics上发表了题为“Atlas of group Astreptococcalvaccine candidates compiled using large-scale comparative genomics”的文章，利用大规模比较基因组学绘制A群链球菌候选疫苗图谱。A群链球菌（Group Astreptococcus，GA
报名|2019年西藏民族大学-复旦大学“生命组学大数据分析及能力提升”暑期课程班
暑期课程班一、背景在精准预测、精准预警、精准医疗大背景下，随着基因分型、新一代测序、传感和图像技术的发展与成熟，产生了海量的基因组数据（包括各类常见和罕见变异、insertion/deletion、CNVs等）及转录组、表观基因组、图像、生理生化、临床信息等一系列表型组数据（包括RNA-seq、methylation-seq 和 Chip-seq等），使得大数据分析成为当前研究多基因复杂疾病易感性
科学家绘制造血干细胞扩增组织的3D转录组图谱
血液系统中贮藏着一种具有自我更新、分化成各种血细胞潜能的成体干细胞，称为造血干细胞，它能够维持机体长久造血和组织稳态。造血干细胞移植是恶性血癌的有效治疗手段，但干细胞来源不足成为限制该治疗广泛应用的瓶颈。因此，造血干细胞的发育，尤其是造血干细胞扩增的研究备受关注。然而，现在的研究主要集中在特定细胞群体或关键因子的“线性化”或“平面化”解析，缺乏全面“立体化”的分析。从系统生物学角度解析
中科新生命：生命表型体现者，从“代谢到脂质到修饰”组学专场报告
代谢组学是系统生物学下游的重要组成部分，在biomarker筛选方面具有独特优势，也是病理/药理机制研究的突破口，同时也可以对转录组或蛋白组学的结果做进一步的验证和挖掘，因此在近几年研究中日益突显出其重要的价值。由于小分子代谢物在理化性质、生物变化等方面的特殊性，代谢组的检测分析方法与数据挖掘均与其他组学有较大的差异。
微生物组学助力癌症免疫疗法，阿斯利康达成合作
近日，Seres Therapeutics宣布将与阿斯利康（AstraZeneca）开展一项为期3年的研究合作。两家公司将从机理方面去试图理解微生物组学如何增益癌症免疫疗法，包括和阿斯利康产品的潜在协同作用。在两年时间内，阿斯利康将向Seres支付2000万美元的分期付款，并为Seres提供与合作相关的研发经费。Seres仍将保留针对癌症的微生物疗法的权利，但阿斯利康将有权与Seres
蛋白翻译后修饰组学技术（PTMScan®)在精准医学中的应用
尽管目前大数据的获得会采用基因组学和转录组学，但是核心的发现还是依赖蛋白质组数据而得到的。近来越来越多的研究表明蛋白组学驱动的精准医学具有极大的实用性和普适性，蛋白组学的研究更加速了临床转化的进程。蛋白翻译后修饰（post-translational modification, PTM)赋予了蛋白种类的丰富性及蛋白功能的多样化，研究蛋白翻译后修饰不仅可以确定蛋白修饰（磷酸化、泛素化、酰化、甲基化、
Science：我国李亦学课题组和杨辉课题组揭示胞嘧啶碱基编辑器诱导大量的单位点脱靶突变
2019年3月2日讯/生物谷BIOON/---基因组编辑在治疗由致命性突变引起的遗传疾病上有很大的潜力。对基因组编辑的脱靶效应进行全面分析是验证这种编辑实用性所必需的。科学家们已开发出多种方法来检测全基因组范围内的基因编辑脱靶位点。然而，这些方法并不适用于检测体内的单核苷酸变异（SNV）。在一项新的研究中，中国科学院的李亦学（Yixue Li）课题组、杨辉（Hui Yang）课题组和美国斯坦福大学