Science:新研究开发出一种基于DNB阵列构建的空间分辨高通量单细胞转录组平台
Stereo-cell建立了一个具有空间和多模式能力的高通量单细胞转录组学整合框架。该平台克服了现有方法的关键限制,提高了分析细胞间相互作用、微环境和亚细胞基因表达的可扩展性、灵活性和精确度。
2025-08-26
Nature Methods :“等深度”模型重塑空间生物学格局!深度学习与空间转录组学的完美结合
GASTON通过结合无监督的深度神经网络与可解释性算法,创新性地提出了“等深度”(Isodepth)的概念。
2025-02-01
中国学者一作Nature论文:绘制转移性胰腺癌转录组可塑性空间图谱
不同患者的原发灶与其多器官转移灶之间缺乏统一的克隆进化模式,即使在同一器官内部,也可观察到多个独立克隆亚群的共存。此外,癌细胞的谱系表型与其克隆起源无严格对应性,而是显著地与其所处的肿瘤微环境相关联。
2025-04-27
Nature Methods:当百年病理学遇见AI——iSCALE赋能H&E图像,预测细胞级空间转录组
iSCALE 的诞生,为研究人员提供了一种全新的“世界观”和方法论,彻底改变了我们在大尺度上探索组织微观世界的游戏规则。
2025-09-18
单细胞与空间多组学前沿:探索从转录调控到蛋白网络的生命奥秘
2025-08-21
Nature:从基因组伤痕到转录组静默——单细胞多组学揭示大脑衰老的因果链条
研究为我们提供了一张前所未有的高分辨率地图,以前所未有的深度和广度,揭示了人类大脑在从婴儿期到百岁高龄的漫长旅程中,细胞层面发生的深刻变革。
2025-09-06
大脑中的“园丁”与“杂草”Nature:利用空间转录组时钟揭示大脑衰老过程中的细胞邻近效应
这项研究表明,细胞之间的互动——而不仅仅是单个细胞的特性,在塑造衰老过程中起着关键作用。
2024-12-27
Nature Genetics:任善成/谌科/古迪团队绘制首个成年人前列腺空间转录组学图谱,揭示前列腺新的生理功能和癌变机制
该研究构建了首个高分辨率成年人前列腺空间图谱,系统解析了前列腺的空间异质性与细胞组成。
2025-04-04
科研人员开发基于深度学习模型的空间转录组精细分辨率细胞注释算法
STASCAN提供了用于整合空间基因表达信息和组织学图像进行精细分辨率细胞注释的工具,在解码细胞空间精细分布和解析特异组织结构方面具有优势。
2024-11-10