Nature Methods：肿瘤进化的空间图谱，CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化
CalicoST算法的诞生填补了这一空白。它不仅能够从空间转录组数据中推断出肿瘤的等位基因特异性拷贝数变异，还能够重建肿瘤克隆在空间中的进化轨迹，绘制出肿瘤演化的“进化地图”。
2024-11-10
Nature Methods：肿瘤进化的空间图谱：CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化
CalicoST算法的核心优势在于其能够从SRT数据中精确推断等位基因特异性拷贝数变异（allele-specific CNAs）。
2024-11-23
Nat Cancer：王红阳/陈磊团队绘制肝细胞癌单细胞分辨率空间原位蛋白图谱，揭示肝细胞癌微环境空间异质性
利用CODEX技术，研究人员对401名HCC患者的肿瘤样本进行36种抗体染色，分辨率达0.377 μm/pixel，一共获得了4,347,731个细胞，定义了72个细胞表型以及40个细胞邻域关系。
2024-10-03
Nature：首次构建出人类胸腺细胞空间图谱，揭示人体免疫反应如何在生命早期建立和维持
这项研究的一项重要成果是开发了一种名为OrganAxis的标准化高分辨率空间绘图方法，用于比较胸腺样本在不同发育阶段的组成和结构组织，其分辨率比以往任何时候都要高得多。
2024-11-26
Cell：新研究构建出肠道细胞的空间图谱，并在肠道炎症过程中追踪它们的轨迹
在以前的研究中，IAF已在癌症和自身免疫性疾病等多种疾病中观察到，因此了解IAF的作用和机制可能有助于开发治疗这些疾病的方法。
2024-04-22
科学家破译枸杞子基因组图谱
该研究基于三代测序技术、光学图谱技术、自研高效三维基因组捕获技术等方法，对枸杞进行de novo的基因组组装，突破枸杞基因组高杂合、高重复的瓶颈，获得枸杞高精度基因组图谱。
2024-12-31
人体图谱带来的科学革命
在过去的研究中，研究人员已经揭示了细胞作为生命基本单位的诸多奥秘，但随着技术的进步，人们发现，这还远远不够。细胞的内部不是一片混沌，而是被划分为不同的“区域”，每个区域都扮演着特定的功能。
2024-12-17
单细胞图谱如何‘活’起来？
单细胞图谱正在让精准医学从愿景走向现实。从精准诊断到靶向治疗，再到个体化医疗，这张不断完善的“细胞地图”，将引领我们走向一个更健康、更精准的医学新时代。
2024-12-22
