Nature Methods ：“等深度”模型重塑空间生物学格局！深度学习与空间转录组学的完美结合
GASTON通过结合无监督的深度神经网络与可解释性算法，创新性地提出了“等深度”（Isodepth）的概念。
2025-02-01
Science：AI造“钥匙”，精准开锁癌细胞：深度学习开启蛋白设计新纪元
研究团队展示了一种颠覆性的策略，利用生成式人工智能(Generative AI)从零开始设计全新的蛋白质，这些蛋白质能像高精度的“分子巡警”，精准识别并锁定癌细胞或病毒感染细胞表面的独特“身份证”。
2025-08-03
Nature Biotechnology：D-I-TASSER——深度学习与物理模拟“联手”，蛋白质预测超越AlphaFold
在CASP15盲测中，D-I-TASSER表现惊艳，在单域和多域蛋白质预测上均展现出卓越性能，超越了AlphaFold2和AlphaFold3！
2025-05-28
Nature Methods：当深度学习遇见纯净数据，DeepMVP为精准医学画出蛋白质功能新图谱
研究人员将DeepMVP应用于癌症基因组图谱（TCGA）中超过79万个癌症体细胞突变，预测发现其中高达31%的突变会显著改变PTM。
2025-08-30
Science：突破性进展，深度学习+物理模拟，精准操控蛋白质“形态切换”，未来药物设计新路径
这项研究不仅成功地从头设计出能够精确切换两种预设构象的动态蛋白质，更实现了通过配体结合和远端变构突变对其构象平衡的精细调控。
2025-05-27
Nature Methods：超越形态学边界——GHIST深度学习框架实现从细胞结构到基因功能的精准预测
GHIST的出现，为我们描绘了一幅计算病理学的未来图景。在这个未来里，每一张被存放在医院档案室里、积满灰尘的H&E病理切片，都有可能被重新唤醒，转化为蕴含着丰富基因信息的数字宝藏。
2025-09-22
Nature Methods：从序列到结构——RhoFold+深度学习模型实现RNA 3D预测的高效革命
通过结合深度学习和语言模型的力量，RhoFold+实现了对RNA 3D结构的高效预测，克服了传统方法的瓶颈，为RNA功能和应用的深入研究开辟了新天地。
2024-12-01