单细胞和空间转录组中环形RNA深度学习算法取得进展
CIRI-deep可以实现多种转录组测序数据中差异剪接环形RNA的可靠预测,并在单细胞及空间水平实现细胞类型特异环形RNA的准确解析,具有广泛的应用场景。
Science:科学家开发出能帮助理解人类基因组中转录起始的特殊机器学习模型
研究人员开发了一种名为Puffin的机器学习程序,当分析了数以万计已知的人类启动子数据后,这种新型程序就能确定其由三种类型的序列模式所组成,即基序、启动子和三核苷酸(trinucleotides)。
科研人员研发深度学习系统:可精准预测糖尿病视网膜病变进展
研究团队通过将该系统应用于中国和印度的真实临床流程,证实该系统可在大幅降低筛查频率和公共卫生成本的情况下仍保持极低的漏诊率,从而为将来的糖尿病并发症防控实践提供了个性化筛查和管理决策的依据。
Nat Commun:科学家开发出深度学习模型来理解人类基因组的奥秘
来自美国西北大学等机构的科学家们通过研究开发出了一种深度学习算法,其或能够识别基因组上发生的聚腺苷酸化的位置,这一研究进展或有望加速对DNA转录过程发生错误时出现的疾病和障碍进一步深入研究。
新型3D体外模型的突破性进展!J Hepatol:3D肝细胞模型助力破解脂肪肝之谜
来自海德堡大学医院等机构的科学家们通过研究开发了一种能用于检测脂肪肝药物疗效的新型模型系统,其是一种基于原代人类肝脏实质细胞(肝细胞)的3D体外细胞培养系统。
猪胚胎干细胞诱导形成类囊胚模型
该研究建立了将猪胚胎干细胞诱导为类囊胚的技术体系,首次将猪胚胎干细胞诱导形成类囊胚模型。猪是重要的畜牧业动物,也是理想的疾病模型,更是人源化器官的潜在供体。
科研人员人工智能细胞大模型
清华大学自动化系生命基础模型实验室主任张学工教授、电子系/AIR马剑竹教授和百图生科宋乐博士合作,建立了一个名为scFoundation的细胞大模型。
空间组学数据解析肿瘤微环境的异质图学习方法
该研究提出了名为stKeep的新模型。该模型构建了三种不同节点即细胞/spot、基因和肿瘤区域以及八种连接关系的异构图模型,用于刻画肿瘤微环境。
Nature:猫的大脑为什么是研究老年痴呆的理想模型?
猫在老化过程中,其大脑会表现出类似人类的萎缩和认知退化特征。研究人员希望通过这些数据,揭示年龄相关疾病,尤其是神经退行性疾病(如阿尔茨海默病)的病理机制。
Nature:人类自免疫类器官模型揭示乳糜泻的病理过程
这项研究成功建立了一个保留上皮和免疫细胞多样性的ALI体外CeD类器官病理模型,重现了CeD的Gluten依赖性病理过程,揭示了IL-7在CeD中的关键作用,并为体外研究自身免疫疾病提供了新的方法。