打开APP

Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱,CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化

CalicoST算法的诞生填补了这一空白。它不仅能够从空间转录组数据中推断出肿瘤的等位基因特异性拷贝数变异,还能够重建肿瘤克隆在空间中的进化轨迹,绘制出肿瘤演化的“进化地图”。

2024-11-10

Cell:首次构建出食物中的化合物与人体肠道细菌相互作用的分子图谱

这种分子图谱为解释不同人群之间的这些不同反应提供了一种机制,显示了膳食化合物如何影响肠道微生物的生长,以及该化合物在代谢上如何被肠道微生物群落改变。

2024-10-18

Cell子刊:魏文胜团队利用碱基编辑器筛选绘制DNA损伤应答功能元件图谱

该研究通过碱基编辑器筛选,绘制了DNA损伤应答功能元件图谱。

2024-12-18

Science:利用单细胞染色质可及性图谱揭示原发性人类癌症中的恶性调控程序

多种人类原发性癌症类型的 TCGA 单细胞图谱和用于解释癌症中顺式调控元件的可解释深度学习模型,为了解导致原发性人类癌症恶性表型的分子程序提供了新的资源。

2024-09-27

Nature:首个人类大脑血管分子图谱震撼发布!为跨学科合作搭建了桥梁

这份详尽的单细胞大脑血管图谱,不仅为我们提供了关于发育、成年及疾病状态下人类大脑血管系统分子架构与异质性的深度洞察,更为后续研究奠定了坚实的基础,预示着脑科学领域即将迎来一场革命。

2024-07-15

Dev Cell:余逸群/余洪猛/刘环海/任雯雯绘制嗅上皮衰老的单细胞转录组图谱

该研究建立了哺乳动物嗅上皮衰老的单细胞转录组图谱(图1),解析嗅上皮细胞类型特异性的衰老相关差异表达基因,发现衰老导致嗅上皮中存在激活型HBC,揭示Egr1和Cebpb是转录调控网络中的核心因子。

2024-08-27

Nat Immunol:科学家成功绘制出新型细胞图谱,有望揭示治疗治疗人类炎性肠病的新途径

这项研究中研究人员绘制的治疗性图谱或代表了最常见的生物疗法—抗肿瘤坏死因子疗法在多种人类炎性疾病中扰动的最大细胞普查。

2024-11-11

Nature:首次构建出人类胸腺细胞空间图谱,揭示人体免疫反应如何在生命早期建立和维持

这项研究的一项重要成果是开发了一种名为OrganAxis的标准化高分辨率空间绘图方法,用于比较胸腺样本在不同发育阶段的组成和结构组织,其分辨率比以往任何时候都要高得多。

2024-11-26

冬小麦春化建立、维持和重置过程中的转录及染色质动态图谱获得进展

中国科学院遗传与发育生物学研究所肖军研究组利用RNA-seq、ATAC-seq和CUT&Tag技术,绘制了田间冬小麦春化建立、维持和重置过程中的转录及染色质动态图谱。

2024-07-13

Nature子刊:龙尔平等合作建立人类肺组织单细胞多组学图谱定位肺癌遗传易感靶点

人类肺组织单细胞多组学图谱具有广阔的应用前景,与蛋白组和微生物组图谱联合,揭示不同组学层次间的互作机制,并拓展至慢性阻塞性肺疾病(慢阻肺病)等重大呼吸疾病,解析不同病程和表型间的分子机制。

2024-09-16