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Cell Rep:刘行/姚雪彪/王志凯合作揭示细胞更新转录调控新机制

该研究发现了书签标识因子FOXA1在细胞有丝分裂期过程中DNA结合模式转变的磷酸化调控机制,以及FOXA1转录凝聚体的形成与功能发挥的分子基础。

2024-09-22

Mol Cell:HOXDeRNA 通过与基因组广泛结合激活癌症转录程序和超级增强子

HOXDeRNA通过rG4结构结合EZH2并招募到PRC2标记的基因组区域,从而去除PRC2对关键胶质瘤转录因子和超级增强子的抑制,最终激活多个癌症驱动基因,驱动星形胶质细胞向胶质瘤转化。

2024-11-07

Cell Metab:吕德官等揭示胶质母细胞瘤中调控表观转录的关键代谢途径

该发现揭示了MDH2是维持GSCs代谢和表观转录组网络的关键环节,为开发更为有效的靶向治疗方案铺平了道路。

2024-11-06

Nature子刊:抑制线粒体DNA转录,可逆转肥胖和肝脏脂肪变性

该研究团队在高脂饮食小鼠中观察到肝脏大泡性脂肪变性,而IMT治疗显著减少了肝脏脂肪变性,导致肝脏中脂质含量减少和肝脏重量减轻。

2024-05-06

科研人员开发基于深度学习模型的空间转录组精细分辨率细胞注释算法

STASCAN提供了用于整合空间基因表达信息和组织学图像进行精细分辨率细胞注释的工具,在解码细胞空间精细分布和解析特异组织结构方面具有优势。

2024-11-10

Nat Commun:通过整合细胞形态学和空间转录组学深度剖析肿瘤生态系统

METI是一种机器学习方法,它通过整合空间基因表达数据和病理学组织学特征,系统性地分析肿瘤生态系统。

2024-09-04

Nature Methods | 解码基因调控新机制:系统性发现人类转录组中的RNA结构开关

该研究展示了RNA结构开关在基因表达调控中的重要性,并强调了开发新的RNA开关鉴定方法的必要性。未来,SwitchSeeker有望被应用于更广泛的转录组研究中,揭示更多关于RNA结构和功能的奥秘。

2024-07-20

iScience:利用诱导性多能干细胞构建研究肥厚型心肌病的体外模型

基因突变发生在基因组中编码力学、挤压蛋白的部分,即肌节(sarcomeres)。如果运动蛋白出了问题,为什么电流会受到影响?

2024-07-07

冬小麦春化建立、维持和重置过程中的转录及染色质动态图谱获得进展

中国科学院遗传与发育生物学研究所肖军研究组利用RNA-seq、ATAC-seq和CUT&Tag技术,绘制了田间冬小麦春化建立、维持和重置过程中的转录及染色质动态图谱。

2024-07-13

Dev Cell:余逸群/余洪猛/刘环海/任雯雯绘制嗅上皮衰老的单细胞转录组图谱

该研究建立了哺乳动物嗅上皮衰老的单细胞转录组图谱(图1),解析嗅上皮细胞类型特异性的衰老相关差异表达基因,发现衰老导致嗅上皮中存在激活型HBC,揭示Egr1和Cebpb是转录调控网络中的核心因子。

2024-08-27