循环血微小RNA在诊断急性心肌梗死中的应用前景
随着我国经济的发展和人民生活水平的提高、饮食结构和环境因素的改变，以血管功能失衡为病理学基础的心脑血管疾病的发病率呈逐年上升趋势，对我国人民群众健康构成了极大威胁。最近研究表明，多种miRNA参与了胚胎发育、心血管疾病发生、肿瘤发生等生理病理进程。MiRNA在不同组织中具有不同的表达谱，在循环血中并具有较高的稳定性。各种组织在不同原因引起的损伤时，循环血中miRNA含量会发生相应的改变，有可能在相关疾病的发生发展中作为分子标志物。我们在研究中发现，心肌特异的miR-208a能够作为心肌缺血的血清标志物，具有较高的灵敏性和特异性。血管损伤及随后由其引起的重塑在冠心病、高血压等心脑血管疾病中也发挥重要作用，研究表明循环血miRNA也具备作为血管损伤重塑相关疾病的血清标志物的潜在价值。
晶芯® 人类长链非编码RNA芯片V3.0的设计及在疾病研究中的应用
长链非编码RNA (lncRNA)以RNA的形式在多种层面上，通过影响染色质状态，RNA转录和翻译层面调控基因的表达。近年研究者非常关注lncRNA在各种生物学过程和疾病过程中所起到的作用，形成了新的研究热点。 博奥生物与中科院生物物理所陈润生院士研究组，基于已经公布的大量lncRNA数据库及实验室发现的800多条中等长度的非编码RNA，推出了自主设计的lncRNA芯片。继成功推出lncRNA V1.0 和 V2.0 芯片基础上，鉴于当前lncRNA 研究的快速进展，收集和更新lncRNA 序列信息，经过严格的序列筛选和整合，推出了新一代的晶芯lncRNA V3.0 芯片服务。最新的V3.0芯片包括约3.8万条lncRNA和约3.4万条mRNA探针，可以同时针对lncRNA和mRNA进行检测。在充分保证探针容量和重复数量（lncRNA和mRNA检测探针均重复2次以上）的前提下，降低了芯片成本和实验费用。在检测成本和检测准确性之间达到较好的平衡点。 通过lncRNA芯片检测，研究人员能够迅速获得与特定生物学过程或者疾病相关的lncRNA的表达变化，从而发现与特定生物学过程相关的lncRNA，寻找与疾病相关的lncRNA。
细菌非编码RNA的系统发现和功能研究
毕研究员等开展了结核菌非编码RNA系统发现、标注及功能研究来回答其有多少非编码RNA？基因组定位？与结核菌的致病性和耐药产生相关的有哪些？可望在结核菌的致病和耐药机制方面获得重要发现，为结核病的治疗和预防提供重要依据。
杨瑞馥：POCT：个体化医疗时代和公共安全的需求与挑战
随着生物安全、食品安全、突发和新发疫情和自然灾害等问题日益突出，POCT在现场快速检测、确定病原等危害因子和制定有效预防措施中将发挥不可替代的作用。但是，POCT技术与中心实验室的检测手段不同，还存着管理、质量控制、培训、认证认可等问题。我们还需从POCT文化建设、管理机构确定和管理标准化以及质控、认证等的规范化等角度逐步解决。
转录因子和miRNA在复杂疾病中的共调控网络研究
Transcription factors (TFs) are key regulators controlling the transcription of target genes by binding to specific DNA sequences on the promoter of target genes. Both the TFs and miRNAs are regulators of gene expression and they may mutual regulate each other to form feedback loops (FBL), or they regulate the same target gene to form a feed-forward loop (FFL). It has been reported that hundreds of potential miRNA-mediated feedback and feed-forward loops are available at the genome level. To predict the TF-miRNA co-regulatory FFL and FBL loops, we integrated multiple data of TF targets and miRNA targets including both experimentally validated and predicted. Thus, we developed a strategy to predict the TF-miRNA co-regulatory FFL and FBL loops. We used these methods to study the TF-miRNA co-regulation in specific diseases including schizophrenia and T-cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL). We identified and verified some key miRNA and genes in these diseases. In the T-ALL, we obtained 120 FFLs among T-ALL related genes, miRNAs and TFs. Afterwards, a T-ALL miRNA and TF co-regulatory network was constructed and its significance was tested by statistical methods. Four miRNAs in the miR-17~92 cluster and 4 important genes (CYLD, HOXA9, BCL2L11, and RUNX1) were found as hubs in the network. Particularly, we found that miR-19 was highly expressed in T-ALL patients and cell lines. Ectopic expression of miR-19 repress CYLD expression, while miR-19 inhibitor treatment induce CYLD protein expression and decreases NF-κB expression in the downstream signaling pathway. Thus, miR-19, CYLD and NF-κB form a regulatory feed-forward loop, which provides new clues for sustained activation of NF-κB in T-ALL. Some single nucleotide polymorphisms (SNPs) in miRNA genes or target sites (miRNA-related SNPs) have been proved to be associated with human diseases by affecting the miRNA mediated regulatory function. To systematically analyze miRNA-related SNPs and their effects, we performed a genome-wide scan for SNPs in human pre-miRNAs, miRNA flanking regions, target sites and designed a pipeline to predict the effects of them on miRNA-target interaction. As a result, we identified 48 SNPs in human miRNA seed regions and thousands of SNPs in 3'- untranslated regions with the potential to either disturb or create miRNA-target interactions. Furthermore, we experimentally confirmed 7 loss-of-function SNPs and 1 gain-of-function SNP by luciferase assay. All useful data were complied into miRNASNP, a user-friendly free online database (http://www.bioguo.org/miRNASNP/). These data will be a useful resource for studying miRNA function, identifying disease-associated miRNAs, and further personalized medicine.
口腔颌面-头颈部黑色素瘤的个体化诊治与思考
近十年上海第九人民医院由原来的单纯手术切除发展为采用多学科的个体化序列治疗的方法:原发灶冷冻治疗→术前辅助化疗→选择性颈清术±原发灶切除→生物治疗→康复治疗，口腔黏膜恶性黑色素瘤5年生存率由单纯手术治疗的0提高到30.3%。
肝癌的转化医学研究
在肝癌中，分子诊断标记物的筛选、分子分型及个体化靶向药物的发展是转化医学中非常重要的领域。转化医学的发展将沟通基础研究及临床实践，不但可以提高对肝癌发生、发展相关分子机制的理解，而且将促进肝癌临床治疗的发展及进步。
林旭：中国人群营养和遗传因素与代谢性疾病的队列研究
林旭研究员介绍了其团队针对中国人群营养和遗传因素与代谢性疾病相关的研究成果： 1 亚洲人比白种人更易罹患糖尿病，中国人更具有“代谢性肥胖”特征。2 中国人群代谢性肥胖表型和疾病的高易感性，不仅仅与遗传因素相关，环境因素也起了非常重要的作用。上世纪90年代以来我国居民膳食能量来源的巨大改变，随之而来的是，近年来我国糖尿病患者数量激增。 3 北京上海两地原住民饮食习惯的不同，更为合理膳食搭配使得上海居民糖尿病患病率低于北京。4 维生素D、乳制品的摄取可降低糖尿病的发病率。体内视黄醇结合蛋白4、C反应蛋白、铁蛋白、内毒素结合蛋白含量的升高预示罹患糖尿病的风险增加。
氨酸酸的薄层层析
本课程是由南方医科大学基因工程研究所提供的氨酸酸的薄层层析视频，详细的介绍了氨酸酸的薄层层析法的原理及操作技术，包括实验器材，注意事项层析法的分类等知识
质粒DNA的提取、纯化与鉴定
本课程是由南方医科大学基因工程研究所生物化学与分子生物学实验教学中心提供的，内容主要讲述了质粒DNA的提取、纯化与鉴定的实验原理及实验材料方法和实验步骤