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Nature:抑制A→I RNA编辑的遗传变异与自身免疫性疾病的风险增加相关

  1. 自身免疫性疾病
  2. 遗传变异
  3. RNA编辑
  4. 腺苷脱氨酶

来源:生物谷原创 2022-08-23 10:22

在一项新的研究中,研究人员发现有证据表明,抑制A→I RNA编辑(A-to-I RNA editing)的遗传变异可能与自身免疫性疾病的风险增加有关。

在一项新的研究中,来自美国斯坦福大学、布罗德研究所和中国复旦大学的研究人员发现有证据表明,抑制A→I RNA编辑(A-to-I RNA editing)的遗传变异可能与自身免疫性疾病的风险增加有关。相关研究结果发表在2022年8月18日的Nature期刊上,论文标题为“RNA editing underlies genetic risk of common inflammatory diseases”。在这篇论文中,他们描述了他们如何分析从数百名人类供者那里收集的组织样本的基因表达数据,以确定影响RNA编辑的遗传变异,以及他们通过这样做所了解到的情况。爱沙尼亚塔尔图大学的Kaur Alasoo在同期Nature期刊上发表了一篇标题为“Genetic variants that edit risk of autoimmune diseases”的新闻与观点类型文章,概述了这些作者在这项新研究中开展的研究工作。

先前的研究已表明,遗传变异可以增加一个人患某些疾病的风险。在某些情况下,它们通过影响RNA来做到这一点---这类遗传变异可能导致产生比正常情况下更多或更少的RNA,或者导致转录序列的差异。在后一种情况下,这种差异可能导致氨基酸测序出现问题。

人们还发现在进行A→I RNA编辑时,遗传变异对RNA分子产生影响,其中A→I RNA编辑是一种涉及RNA碱基从腺苷(A)转变为肌苷(I)的过程。在这项新的研究中,这些作者调查了遗传变异与自身免疫性疾病之间存在关联的可能性。

人体组织中的RNA edQTL图谱,图片来自Nature, 2022, doi:10.1038/s41586-022-05052-x。

这项新的研究涉及从基因型-组织表达(Genotype-Tissue Expression)目录中提取数据,并对这些数据进行过滤,以找到影响RNA编辑的遗传变异。在这样做的过程中,他们发现了来自838名人类供者的组织的数据,在这些数据中,存在有此类遗传变异。在分析这些遗传变异时,他们发现它们影响腺苷脱氨酶(adenosine deaminase)和RNA之间的结合强度。

这些作者接下来发现,这些遗传变异在患有自身免疫性疾病(如狼疮)的人中很常见。最后,他们发现这类遗传变异似乎比参与基因剪接的遗传变异与此类疾病有更强的关联性。他们的结论是,他们观察到的导致抑制A→I RNA编辑的遗传变异似乎与自身免疫性疾病的风险增加有关。(生物谷 Bioon.com)

参考资料:

Qin Li et al. RNA editing underlies genetic risk of common inflammatory diseases. Nature, 2022, doi:10.1038/s41586-022-05052-x.

Kaur Alasoo. Genetic variants that edit risk of autoimmune diseases. Nature, 2022, doi:10.1038/d41586-022-01641-y.

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