全新Nature论文揭示SARS-CoV-2病毒-人类蛋白相互作用图谱，并鉴定出69种靶向这些相互作用的化合物
来源：本站原创 2020-05-03 17:20
2020年5月3日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，一个由大约100名科学家组成的研究团队首次合作，在受感染的人细胞中克隆并表达了29种SARS-CoV-2蛋白中的26种，随后他们鉴定出与每种病毒相互作用的数百种人类蛋白。这些病毒与宿主蛋白的相互作用对于2019年冠状病毒病（COVID-19）在人体中的产生至关重要。因此，准确阐明这些蛋白相互作用
2020年5月3日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，一个由大约100名科学家组成的研究团队首次合作，在受感染的人细胞中克隆并表达了29种SARS-CoV-2蛋白中的26种，随后他们鉴定出与每种病毒相互作用的数百种人类蛋白。这些病毒-宿主蛋白相互作用对于2019年冠状病毒病（COVID-19）在人体中的产生至关重要。因此，准确阐明这些蛋白相互作用可能对开发新的抗病毒药物或重新利用已知的药物来对抗COVID-19具有重要意义。相关研究结果于2020年4月30日在线发表在Nature期刊上，论文标题为“A SARS-CoV-2 protein interaction map reveals targets for drug repurposing”。
在利用一种名为“亲和纯化质谱（affinity purification mass spectrometry）”的技术鉴定出332种高可信度的病毒-人类蛋白相互作用后，这些研究人员确定了66种可被药物靶向的人类蛋白和69种靶向这些蛋白的化合物。在这些化合物中，29种是已经获得美国食品药品管理局（FDA）批准的药物，12种正在进行临床试验，28种是临床前化合物。
这些研究人员随后在多种病毒测定方法中筛选了这些化合物的一部分，找到了两组具有抗病毒活性的药物试剂：抑制信使RNA（mRNA）翻译的抑制剂；两种细胞受体蛋白Sigma1和Sigma2的预测调节剂。
论文共同作者、美国北卡罗来纳大学教堂山分校医学院药理学教授Bryan L. Roth博士说，“我们认为作为帮助治疗COVID-19患者的治疗方案的一部分，其中的一些已知的试剂或者尚未制造出的类似化合物---当与直接靶向病毒酶的药物组合使用时---值得研究。”
新型冠状病毒SARS-CoV-2导致COVID-19呼吸道疾病，已经感染了200多万人，造成20多万人死亡，并在全球范围内造成了社会和经济的混乱。尽管一种称为瑞德西韦（remdesivir, 也称为GS-5734）的药物正在进行临床试验，但是目前还没有抗病毒药物被证明具有临床疗效。目前还没有可用的疫苗，尽管有几种疫苗正在进行临床试验。开发药物和疫苗的努力由于对SARS-CoV-2感染分子细节的有限了解而受到阻碍，这也是Roth和同事们合作确定宿主-病毒之间的相互作用并筛选可能靶向这些相互作用的化合物的原因。
Roth说，“这是一个巨大的努力。令人惊讶的是，这个由100名研究人员组成的研究团队竟然这么快就完成了这项研究，这是因为这种冠状病毒的基因序列直到今年1月才能用于研究。”
Roth表示，靶向病毒-宿主蛋白相互作用是一个行之有效的策略。比如，常用于治疗HIV感染的药物混合物中的一种化合物就是靶向这样的相互作用。
不过他提醒道，仅仅因为几种已知的药物靶向Sigma1和Sigma2或其他与SARS-CoV2相关的蛋白，并不意味着它们会在患者体内产生强烈的抗病毒作用。这篇论文中的所有实验都是在实验室中进行的体外实验。不过，了解这些基础的生物学机制为研究可能具有强大效果的化合物奠定了重要的基础。（生物谷 Bioon.com）
参考资料：
1.David E. Gordon et al. A SARS-CoV-2 protein interaction map reveals targets for drug repurposing. Nature, 2020, doi:10.1038/s41586-020-2286-9.
2.Scientists reveal host- SARS-CoV-2 protein targets for drug repurposing
https://medicalxpress.com/news/2020-05-scientists-reveal-host-sars-cov-protein.html
图片来自NIAID-RML。
在利用一种名为“亲和纯化质谱（affinity purification mass spectrometry）”的技术鉴定出332种高可信度的病毒-人类蛋白相互作用后，这些研究人员确定了66种可被药物靶向的人类蛋白和69种靶向这些蛋白的化合物。在这些化合物中，29种是已经获得美国食品药品管理局（FDA）批准的药物，12种正在进行临床试验，28种是临床前化合物。
这些研究人员随后在多种病毒测定方法中筛选了这些化合物的一部分，找到了两组具有抗病毒活性的药物试剂：抑制信使RNA（mRNA）翻译的抑制剂；两种细胞受体蛋白Sigma1和Sigma2的预测调节剂。
论文共同作者、美国北卡罗来纳大学教堂山分校医学院药理学教授Bryan L. Roth博士说，“我们认为作为帮助治疗COVID-19患者的治疗方案的一部分，其中的一些已知的试剂或者尚未制造出的类似化合物---当与直接靶向病毒酶的药物组合使用时---值得研究。”
新型冠状病毒SARS-CoV-2导致COVID-19呼吸道疾病，已经感染了200多万人，造成20多万人死亡，并在全球范围内造成了社会和经济的混乱。尽管一种称为瑞德西韦（remdesivir, 也称为GS-5734）的药物正在进行临床试验，但是目前还没有抗病毒药物被证明具有临床疗效。目前还没有可用的疫苗，尽管有几种疫苗正在进行临床试验。开发药物和疫苗的努力由于对SARS-CoV-2感染分子细节的有限了解而受到阻碍，这也是Roth和同事们合作确定宿主-病毒之间的相互作用并筛选可能靶向这些相互作用的化合物的原因。
Roth说，“这是一个巨大的努力。令人惊讶的是，这个由100名研究人员组成的研究团队竟然这么快就完成了这项研究，这是因为这种冠状病毒的基因序列直到今年1月才能用于研究。”
Roth表示，靶向病毒-宿主蛋白相互作用是一个行之有效的策略。比如，常用于治疗HIV感染的药物混合物中的一种化合物就是靶向这样的相互作用。
不过他提醒道，仅仅因为几种已知的药物靶向Sigma1和Sigma2或其他与SARS-CoV2相关的蛋白，并不意味着它们会在患者体内产生强烈的抗病毒作用。这篇论文中的所有实验都是在实验室中进行的体外实验。不过，了解这些基础的生物学机制为研究可能具有强大效果的化合物奠定了重要的基础。（生物谷 Bioon.com）
参考资料：
1.David E. Gordon et al. A SARS-CoV-2 protein interaction map reveals targets for drug repurposing. Nature, 2020, doi:10.1038/s41586-020-2286-9.
2.Scientists reveal host- SARS-CoV-2 protein targets for drug repurposing
https://medicalxpress.com/news/2020-05-scientists-reveal-host-sars-cov-protein.html
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