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Nat Biotechnol:科学家开发出有望加速癌症诊断的新技术—scTRIP

来源:本站原创 2020-01-07 09:01

2020年1月7日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在国际杂志Nature Biotechnology上的研究报告中,来自欧洲分子生物学实验室等机构的科学家们通过研究开发了一种便宜快速的方法来检查单一细胞中的遗传差异,就能够接收到的信息而言,该方法的性能优于现有的技术,这种新方法有望成为单细胞研究的新标准,并有望用于对包括癌症在内的多种疾病进行临床诊断

图片来源:CC0 Public Domain

研究者Ashley Sanders说道,我们所开发的新方法能对单一细胞的遗传改变进行研究,其或有望改变突变检测的研究,这种称之为单细胞三通道处理(scTRIP,single cell tri-channel processing)的技术能帮助研究单细胞中DNA的遗传变异,并能直接测定信息报中所产生的遗传突变;相比仅检测基因组中大规模改变的现有方法而言,scTRIP技术能够细胞中所发生的小规模改变以及利用其它单细胞方法无法观察到的多种类型的遗传变异。

随后研究人员利用scTRIP技术在患者机体的白血病细胞中进行了检测,在受检样本中,研究者发现,利用新技术所发现的患者体内的变异是标准临床诊断所检测到的变异水平的四倍,这包括一个临床相关移位缺失,其能驱动促癌基因的过量表达;此外,研究人员还观察到了灾难性的染色体重排,其在最初的白血病诊断过程中往往会被遗漏,当一条染色体发生断裂并重新按照顺序粘贴在一起时就可能会发生。

研究者Tobias Marschall说道,最初的研究结果表明,这种新方法明显优于现有的方法,其比目前用来揭示单细胞中遗传变异的方法要快得多,同样也便宜得多,这可能对于临床应有非常有意义;如今研究者开始扩展这种方法的应用范围,利用其来分析不同形式的白血病并评估其潜在的临床效用。由于样本的异质性能在单细胞水平下进行很好地研究,全球的研究人员都在致力于开发新型技术来改善所接受到的信息,当前的技术能够揭示不同的细胞如何对疗法产生反应,而且迄今为止,相关的研究和应用都集中在测定细胞内RNA的水平上;然而目前测定单细胞中DNA的水平并未得到应用的关注和重视,对DNA的研究或许有望帮助理解相关遗传改变如何驱动不同细胞行为的发生,本文中,研究者所开发的新方法或许就能满足研究人员和临床医生的需求。

scTRIP技术能组合单个细胞的基因组代码中来自三个不同通道的信息,这就能够帮助揭示单细胞中DNA重排的完整图谱,如今,利用该技术,研究人员就能解决一系列问题,即机体中的一个细胞如何有别于癌症发生时的任何一个细胞,scTRIP技术能够帮助研究人员直接测定细胞中所发生的特殊突变进程,从而产生新型遗传上不同的细胞群体。后期研究人员还计划深入研究来研究不同人类细胞中所发生的突变过程,同时评估这些差异对人类疾病的影响。(生物谷Bioon.com)

原始出处:

Sanders, A.D., Meiers, S., Ghareghani, M. et al. Single-cell analysis of structural variations and complex rearrangements with tri-channel processing. Nat Biotechnol (2019) doi:10.1038/s41587-019-0366-x

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