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肿瘤新纪元:从基因组学向蛋白质组学再次跃进

泛癌症研究的重点是确定不同癌症的分子特征。该研究扩展了之前以基因组学为中心的泛癌症研究,结合蛋白质组学层来阐明癌症驱动因子的六个关键方面

2023-08-17

研究人员开发出定量蛋白质组学数据的下游分析与可视化工具

基于超高分辨率液质联用质谱的定量蛋白质组学已成为重要的生命科学研究手段。与其他组学方法一样,恰当的数据分析流程是蛋白质组学研究的关键。基于质谱的蛋白质组数据具有方法仪器多样、搜库定量软件繁多的特点,导

2023-09-08

Cell Systems封面论文:曾坚阳团队提出蛋白质口袋结构表征新方法

具体而言,对于输入的蛋白质结构,首要任务是确定其表面上anchor的位置。这些anchor位置是通过对蛋白质表面潜在结合配体的空间区域进行采样、过滤、聚类等操作后得到的。

2023-08-21

博士期间已Nature+Science在手,年仅30的她再发Science,揭示全新的蛋白质降解机制

总的来说,这项研究发现的Midnolin-蛋白酶体途径,可能代表了蛋白酶体绕过传统的泛素化系统来实现许多核蛋白选择性降解的通用机制。

2023-09-12

AI蛋白设计再登Nature:Diffusion模型助力更强的蛋白质从头设计

该研究开发了蛋白质从头设计的深度学习算法——Family-wide Hallucination,并通过实验室测试证实,这些自然界中不存在的人造酶可以非常有效地催化荧光素底物发光。这是科学界首次基于深度

2023-07-14

Nature子刊:百图生科宋乐团队开发新型蛋白质结构预测工具,不依赖多序列对比,效率更高

与基于MSA的的主流蛋白质结构预测工具AlphaFold2和RoseTTAFold方法相比,HelixFold-Single在预测效率上具有很大优势,耗时要少得多,可以应用于需要大量预测的蛋白质相关任

2023-10-17

Advanced Science:赵英明/黄河等揭示全新蛋白质修饰类型

细胞代谢为生命过程提供能量,同时,代谢物可共价修饰蛋白质来发挥信号传导功能。虽然许多代谢物在代谢通路中的作用广为人知,但它们介导细胞信号调控的功能有待探索。

2023-07-10

哈佛教授捐赠2.1亿美元用于蛋白质创新研究,计划加速蛋白质和抗体发现

官方新闻稿中指出,这笔捐赠将进一步支持蛋白质创新研究所的发展,以利用新的蛋白质工具和专业知识转变生物医学研究。

2023-06-05

Nature | 由数千种蛋白质组成的最大数据集是人类健康研究的标志性一步

2023年10月4日,《自然》杂志发表了一篇世界上规模最大、最全面的研究成果,该研究涉及常见基因变异对血液中循环蛋白的影响以及这些关联如何导致疾病。通过将生物样本转化为英国生物库的数据,这项史无前例的

2023-10-12

Nat Commun | 复旦大学丁琛/陈治宇通过血浆蛋白质谱揭示结直肠癌诊断和西妥昔单抗治疗反应的生物标志物多样性

该研究揭示了不同生物标志物在肿瘤诊断、西妥昔单抗首疗程和多疗程治疗的初始和纵向疗效预测方面的异质性,可能最终有助于CRC的监测和干预策略。

2024-02-09