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上海交大科研团队精准表征人类完整基因组中的大尺度结构变异

该项研究对GRCh38和T2T-CHM13之间大规模差异基因组区域的结构和功能进行更全面和详细评估。该结果不仅有助于我们对基因组中复杂结构遗传多样性的认识,还提出了消除参考偏差来推动未来的科学研究。

2023-07-17

研究人员利用单精子长读段基因组测序进行高精度单倍型分型

单倍型分型是指将二倍体细胞中两条同源染色体上的各种遗传多态性的连锁关系准确鉴定出来。它是终极分辨率的端粒到端粒的人类参考基因组组装的必要成分。单倍型分型能够帮助研究同一条染色体上不同调控元件遗传变异之

2023-07-27

Molecular Therapy Nucleic Acids:纳米芯片可以对小鼠和人类器官进行高水平的基因组编辑

类器官是来源于胚胎干细胞、成体干细胞(ASCs)或诱导多能干细胞(IPSCs)的自组织三维培养系统。它们比传统使用的二维免疫细胞系更真实地概括了其原始上皮组织的结构、组成和功能。

2023-07-27

研究团队分离出霍氏肠杆菌Z129并揭示其泛基因组特征

近日,牧医所奶产品质量与风险评估创新团队在瘤胃尿素分解菌分离培养方面取得新进展,新分离一株霍氏肠杆菌Z129并揭示泛基因组特征。

2023-07-14

染色质扩展显微镜技术可解开基因组秘密

开启或关闭基因的能力是我们在细胞、个体甚至在健康和疾病方面观察到的多样性的基础。这个过程被称为基因转录,涉及到将储存在我们的DNA中的信息转化为RNA。

2023-07-14

脂肪酸氧化是细胞对DNA损伤的反应的重要参与者,支持DNA修复和基因组稳定

细胞会遇到各种类型的DNA损伤。在这些威胁下,细胞促进一种协调良好的信号反应,称为DNA损伤反应(DDR)。DNA修复是DDR的重要组成部分之一。

2023-08-10

科研人员揭示基因组古病毒复活驱动脑衰老

该研究首次系统地解析了灵长类额叶衰老伴随的组织转录组、单核转录组、蛋白质组及全基因组DNA甲基化层次的多维改变,进而,利用神经病理学检测体系和体外人类神经元衰老模型,提出核纤层(Nuclear lam

2023-06-08

Science:利用240种哺乳动物的基因组揭示人类基因组的独特之处

在过去的1亿年里,哺乳动物适应了地球上几乎所有的环境。Zoonomia项目(Zoonomia Project)的科学家们(下称Zoonomia团队)一直在对哺乳动物基因组的多样性进行编目,他们比较了如

2023-05-06

宏基因组揭示煤矿来源酸性废水的抗性特征研究中获进展

研究发现,污染土壤和背景土壤均具有多药抗性机制占主导地位的抗生素抗性组,这或归因于多药抗性机制相关基因具有抗酸、抗金属等功能。研究进一步发现,AMD污染降低了土壤中ARGs的相对丰度

2023-02-28

Cell:在哈扎族狩猎采集者的肠道微生物中发现了惊人的基因组新颖性

在一项新的研究中,来自美国斯坦福大学等研究机构的研究人员对坦桑尼亚哈扎族狩猎采集者(Hadza hunter-gatherer)的351份粪便样本进行了超深的宏基因组测序。他们详细介绍了他们对来自哈扎

2023-06-26