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单细胞和空间转录中环形RNA深度学习算法取得进展

CIRI-deep可以实现多种转录组测序数据中差异剪接环形RNA的可靠预测,并在单细胞及空间水平实现细胞类型特异环形RNA的准确解析,具有广泛的应用场景。

2024-02-21

科研人员开发uCoTargetX技术实现单细胞多组蛋白修饰与转录并行检测

研究者在此基础上进一步优化革新,发展了uCoTargetX技术,在国际上率先实现单细胞多种组蛋白修饰和转录组的并行检测,为深入研究各种生理病理状态下细胞命运的表观调控提供了强有力的技术工具。

2024-01-16

研究建立首个人类肢体发育的单细胞时空图谱并解析关键调控机制

发育过程中,我们四肢的形成并非一蹴而就,而是经历过复杂的细胞演变过程。在胚胎发育第四周末,四肢仅以简单的几乎均一细胞团形状凸起出现在身体的两侧,但到了第八周,这一细胞团则已经完全分化,形成具有复杂解剖

2023-12-16

Sci Transl Med:科学家绘制出人类足月分娩期间机体胎盘组织的单细胞图谱

研究人员通过利用单细胞RNA测序(也称为单细胞转录组学)创建了胎盘图谱,该图谱能分析单一细胞的活性和型号模式。

2024-01-23

【日程更新】第四届单细胞测序技术应用研讨会暨单细胞&空间学研讨会诚邀您的参与!

“第四届单细胞测序技术应用研讨会暨单细胞&空间组学研讨会”将于2023年12月19-20日在中国·北京召开。

2023-12-06

J Dent Res:新研究成功绘制牙髓干细胞和牙周膜干细胞的基因图谱

在一项新的研究中,来自美国牙医协会福赛斯研究所(ADA Forsyth Institute)和北卡罗来纳大学教堂山分校的研究人员利用单细胞转录组分析,成功绘制了牙髓干细胞(dental pulp st

2024-01-17

Nature:利用新开发的Slide-tags技术在单细胞分辨率上构建组织内细胞遗传活动的空间模式图谱

当科学家们想要在分子水平上研究心脏或大脑等器官内的单个细胞时,他们通常会将组织打碎来分析细胞。这提供了有关基因活性的丰富细节,但无法保留细胞在组织中的位置信息。

2023-12-26

Nature:首次构建出肿瘤中T细胞表达的转录因子图谱,有望开发出更好的癌症免疫疗法

T 细胞是免疫系统中参与杀死癌症的关键成分。肿瘤产生的信号会关闭这些T细胞,部分上是通过迫使它们逐渐分化(成熟)为一种功能低下的状态,即衰竭。

2023-11-23

Nature:中外科学家构建出迄今为止最全面的人类衰老骨骼肌的单细胞图谱

肌肉可以自我修复。这主要是由肌肉干细胞完成的,它们在受伤后开始增殖并分化成肌肉细胞,所产生的肌肉细胞相互融合或与现有肌纤维融合,以修复受损肌肉。

2024-04-28

Cell Genomics:刘琦/严钢团队开发TCR和T细胞转录跨模态整合分析的AI框架——UniTCR

UniTCR提出了一种低质跨模态场景下的免疫组学有效整合和表征的AI框架,以赋能诸多免疫数字解码相关的下游任务分析。

2024-05-06