Nature:中美科学家联袂揭示启动小鼠合子基因组激活的关键转录因子
在一项新的研究中,来自中国清华大学和美国加州大学戴维斯分校的研究人员发现受精卵细胞---称为合子(zygote)---如何进行“重置”,从而使新形成的胚胎能够按照自己的遗传程序
Advanced Science:韩敬东团队开发转录组数据空间重构新算法
该研究建立了一种单细胞/寡细胞转录组数据从头空间重构算法——De Novo Coalescent Embedding(D-CE)。该研究利用细胞-细胞转录相关网络的非线性嵌入方法,从头重构了单细胞转录
空间转录组数据多模态可视化工具研究取得进展
目前已有工具可以将二维切片的基因表达模式进行可视化,或者进一步堆叠多张切片并形成组织的三维静态视图,但在三维空间中对空间转录组数据的分子特征和空间形态进行交互式探索仍然是一个难点。
迄今最大规模研究破解持久性CAR-T细胞转录组特征
Ghorashian团队认为,他们这个研究最重要的发现是发现了持久性CAR-T细胞的独特转录特征。而且这个特征在不同人群、不同CAR-T疗法中也存在。因此这暗示着,这种独特的转录特征有可能代表了持久性
单细胞转录组测序,揭示动物发育过程“古老”和“年轻”基因的表达模式
这一研究揭示了不同细胞类型在转录组年龄上的显著差异,有助于对不同细胞的进化起源进行估计,为理解驱动物种进化的遗传机制提供了新的视角
Nature Aging:揭示调控灵长类器官衰老的表观转录组机制
该研究揭示了三种重要的灵长类器官/组织在生理性衰老过程中的动态m6A修饰变化及其与基因表达稳态的关系,并阐释了METTL3–m6A–NPNT通路维持人类骨骼肌稳态的作用和机制。
Nature重磅:樊荣团队率先实现表观遗传组-转录组联合分析
除了成功实现整个领域期待的在同一组织样品上实现总体染色质可及性和基因表达的联合空间组学分析(Spatial ATAC–RNA-seq),该研究还同时报道了三个特定的组蛋白修饰和基因表达的联合分析
Nature Aging:刘光慧团队等揭示调控衰老的表观转录组时钟
该研究系统揭示了三种重要的灵长类器官/组织在生理性衰老过程中的动态m6A修饰变化及其与基因表达稳态的关系,并且深入阐明了METTL3–m6A–NPNT通路维持人类骨骼肌稳态的作用和机制。
Cell:通过分析宏转录组揭示存在大量的类病毒样ccRNA
在一项新的研究中,来自来自美国国家医学图书馆和合作研究机构的研究人员开发出一种计算流程来识别和更好地了解类病毒和类病毒样共价闭合环状RNA。相关研究结果发表在2023年2月2日的Cell期刊上。