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Nature:用条形码标记基因组中的顺式调控元件提供了对人类基因组的深入了解

在这项研究中,这些作者基于大规模实验数据,开发了几种机器学习模型来预测顺式调控元件(CRE)的调节活动。

2025-01-20

基因组从“线性”变“立体”,研究人员发现了肿瘤演化的新法则

这项工作说明,三维基因组并非DNA序列的被动载体,而是癌症演化中一个积极、动态的参与者。它像一只“无形的手”,通过重塑染色质的空间构象,在基因表达的汪洋中掀起波澜,最终决定了肿瘤这艘巨轮的航向。

2025-08-22

Cell:新研究揭示考拉对考拉逆转录病毒的基因组免疫

逆转录病毒可导致严重疾病,并在塑造人类进化方面发挥了显著作用。

2025-03-17

Science:迄今最大规模人类蛋白互作图谱发布!系统鉴定了17849高置信度蛋白互作,其中3631为全新首次发现

由美国德克萨斯大学西南医学中心研究团队领衔的国际合作项目,成功构建了迄今为止最全面的人类蛋白质相互作用(PPI)预测模型。

2025-10-02

Nature子刊:北京大学魏文胜团队开发先导编辑筛选技术,揭示人类基因组中功能性同义突变

针对这些功能性同义突变,魏文胜团队开发了一种专门的机器学习模型——DS Finder,并借助多方面的实验证据揭示了它们对诸如 mRNA 剪接和转录等各种生物过程的影响。

2025-06-26

《Cell》发现:错误的基因图谱正在误导决策

这项研究的意义远不止于狐狸。保护生物学家利用遗传数据来决定保护哪些种群、如何设计育种计划,以及判断濒危物种是否面临近亲繁殖的风险。如果遗传图谱被扭曲,这些决策就可能建立在不可靠的基础上。

2025-09-30

迄今最精细黑猩猩脑图谱——黑猩猩脑网络图谱发布

近期,中国科学院自动化研究所脑网络组研究团队联合国内外科研机构,发布了迄今为止最精细的黑猩猩脑图谱。这一成果为比较神经科学研究提供了重要工具,并为探讨人脑演化提供了新视角。

2025-01-31

Nat Commun:北京大学邢栋等团队合作研究开发单个哺乳动物精子的三维基因组结构

研究者开发了一种改进的scHi-C方案,该方案大大增加了单个精子产生的接触数量。

2025-05-04

Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱:CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化

CalicoST算法的核心优势在于其能够从SRT数据中精确推断等位基因特异性拷贝数变异(allele-specific CNAs)。

2024-11-23