Nature子刊:谭济民/夏波等开发基因组构象预测模型C.Origami及高通量计算遗传筛选新方法
不同种类细胞中基因组构象的差异决定了基因表达的特异性,进而决定不同细胞类型的功能差异。长久以来,从原位杂交到高通量检测如Hi-C、micro-C技术,基因组构象检测的实验方法通常耗时耗力
2023-01-11
曾虎等建立新型空间测序技术,精确测定阿尔兹海默病的脑细胞变化
该研究将STARmap PLUS用于阿尔茨海默病(AD)小鼠模型,揭示了AD病理特征蛋白质周围的细胞组成和基因表达改变。STARmap PLUS将单细胞基因表达与组织病理连接起来,为精确定位病理过程中
2023-02-07
NAR:中科院深圳先进院马迎飞团队开发高通量制备底盘噬菌体方法
在CiPGr的操作过程中,研究团队只需要获得噬菌体基因组序列,就能够将该方法轻松推广至其他野生型噬菌体而不需要其他先验的知识。
2022-12-21
Nature子刊:哺乳动物细胞高通量基因编辑平台构建及碱基编辑AI预测模型方面获进展
碱基编辑器(Base Editor,BEs)能够有效修改基因组的特定碱基,为纠正人类已知的致病性单核苷酸变异(Single nucleotide variations,SNVs)带来了希望。
2022-12-05
柳叶刀子刊:北大沈宁团队基于国产纳米孔测序平台发表临床多重耐药研究新发现
该论文基于齐碳纳米孔基因测序平台,对临床新出现的携带tmexCD-toprJ的肺炎克雷伯菌进行了广泛研究,是对其流行病学研究的有效补充。
2022-12-12
“九层妖塔”基因密码破解,华大智造测序仪展露古DNA“捕获”硬核本领
华大智造MGISEQ-2000测序仪也已被广泛应用于各种组学研究,并且具有更灵活的读取长度选择、更高通量和更低成本。
2022-12-08
Cell & Nat Commun:全球最大规模的自闭症全基因组测序研究揭示了134个自闭相关的新基因
来自加拿大多伦多病童医院等机构的科学家们通过进行迄今为止最大规模的自闭症全基因组测序分析,结果发现了与人类自闭症谱系障碍(ASD)相关的新型基因和遗传改变。
2022-11-28