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Nature Methods:GPT-4领衔,大语言模型(LLMs)推动基因功能探索新高度

研究发现,LLMs不仅能够提供与现有数据库一致的基因功能描述,还在某些情况下提出了更广泛且合理的生物学解释。

2024-12-13

研究人员构建SAM关键homeobox基因调控网络解析玉米株高发育的分子机制

为构建组织特异性动态调控网络,基于黄化幼苗叶片ATAC-seq和tsCUT&Tag数据,团队设计并训练了一个机器学习模型,以预测SAM组织的调控位点。

2024-10-12

研究揭示黄酮类物质合成新基因簇帮助荞麦属植物适应高海拔

研究团队通过全基因组关联分析发现,苦荞1号染色体上葡萄糖基转移酶基因启动子区域的基因变异与多种黄酮类物质含量密切相关。

2024-10-13

Nature Methods :核苷酸转换模型(Nucleotide Transformer, NT)——解锁基因组预测的新纪元

该模型不仅能像阅读文本一样解读DNA序列,还能够预测基因组中的关键功能区域。

2024-12-12

Cell:转座子——基因组中的“垃圾”如何化身为免疫调控的利器?

IFNAR2-S的出现无疑是基因组进化的一次神来之笔,它不仅丰富了灵长类动物的免疫调控能力,也提醒我们:基因组中的“小插曲”,常常孕育着伟大的生物学创新。

2024-12-22

左撇子背后的基因密码:罕见基因变异与手性倾向的联系

TUBB4B变异与左撇子的关联提供了有力的证据,表明特定的微管蛋白编码基因变异可以直接影响个体的手性偏好。

2024-04-13

Nature:发现与神经发育障碍相关的新基因RNU4-2

这一发现建立在曼彻斯特大学和牛津大学共同领导的工作基础之上,旨在了解人类基因组中不直接编码蛋白的DNA上存在的差异的影响,这些DNA因其未知的作用曾被称为“垃圾DNA”。

2024-07-15

Nat Cell Biol | 吴乔/陈航姿合作揭示全长GSDME通过剪切依赖的方式诱导细胞焦亡

该研究阐明了全长GSDME不依赖蛋白酶剪切诱导细胞焦亡的新机制及其调控模式,进一步证实了全长GSDME与GSDMD一样可以直接诱导细胞焦亡,为研究细胞焦亡的新范式奠定了理论基础。

2024-08-05

Cell子刊:于君团队等推出代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(MASH)的侵入性诊断模型

该研究依托多中心人群研究,建立了针对血清蛋白标志物的机器学习模型,该模型在区分MASH及预测其治疗效果方面展现出了显著潜力。

2024-11-08

Mol Cell:揭示RNA在调节癌细胞中基因表达上所扮演的关键角色

本文研究结果为阐明RNA和TOP1在调节RNAPII依赖性转录所固有的DNA拓扑异构压力中的协调作用提供了新的见解。

2024-09-04