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Science:利用人工智能确定人类基因组转录起始的序列基础

Puffin程序显示,根据这些序列模式的排列方式,它们可以激活或抑制基因的转录。它还能预测这些序列模式的排列如何引导 RNA 聚合酶优先转录 DNA 的单链或同时向相反方向转录两条链。

2024-05-26

Oncotarget:揭示T细胞受体互补决定区特殊序列和renalase-1或许与黑色素瘤患者生存率增加有关

本文研究结果表明,renalase-1(肾酶-1)或许能作为黑色素瘤中T细胞受体识别的一种潜在抗原,同时也被认为能作为开发新型免疫疗法的重要靶点。

2024-08-16

Cell | TR-gnomAD:揭示遗传多样性中串联重复的全新视角

TR-gnomAD提供了一个宝贵的资源,可用于研究和诊断与串联重复扩展相关的遗传疾病,特别是在多种血统中。这项资源的开放获取性和高覆盖率使其成为解读人类遗传多样性中串联重复的重要工具。

2024-04-14

Science:新研究揭示短串联重复序列如何影响基因表达

几十年来,科学家们已经知道,“垃圾 DNA(junk DNA)”实际上起着至关重要的作用:尽管基因组中的蛋白编码基因提供了构建蛋白的蓝图,但是基因组中的一些非编码部分,包括以前

2023-10-17

Nature methods | 从序列到结构:探索CombFold组装算法的三重奏

CombFold能够有效地预测出大型蛋白质复合体的三维结构,即使是对于那些由多个不同亚基构成、结构复杂度高的复合体也同样适用。

2024-02-13

ACS Nano:蛋白胨序列对二维组装机制和动力学的影响

近段时间,来自华盛顿大学材料科学与工程系的Sakshi Yadav Schmid教授及团队利用原位原子力显微镜和时间分辨 X 射线散射法研究了蛋白胨序列对云母表面二维组装机制和动力学的影响。

2024-01-29

Cell Reports封面论文:从不确定中寻求确定,戴俊彪/蔡毅之团队实现串联重复的真核rDNA的深度精简与重塑

该研究实现了串联重复的rDNA阵列的高效定制合成,并引入人工重排系统,成功将单倍体酵母菌株中rDNA拷贝数精简至约8个拷贝,是目前研究发现的可支持生存的最低rDNA拷贝数。

2024-03-03

Nature子刊:汤玮欣团队开发更高活性、更好序列兼容性的腺嘌呤碱基编辑器

由于具有更宽的编辑窗口与更好的序列兼容性,ABE8r可以有效编辑其他ABEs难以编辑的疾病相关位点。

2024-01-03

诺奖团队用CRISPR“粉碎癌症”,靶向非编码序列,清除脑肿瘤

这种基于CRISPR的癌症粉碎提出了一种创新的治疗范式,它独立于肿瘤的遗传和表观遗传起源,将超突变癌症的肿瘤突变负荷和化疗药物TMZ信号转化为一种潜在治疗途径。

2023-12-04

Nature:利用6156个人类基因组序列成功构建出人类基因组约束图谱

每个人的基因组都有数百万个基因变异,但大多数变异几乎没有影响,这使得临床医生很难根据基因差异进行医学诊断。

2023-12-28