Nature子刊:新研究揭示人类聚合酶θ定位DNA微同源序列,用于双链DNA断裂修复
来源:生物谷原创 2025-03-15 09:56
通过低温电镜和生化实验,该团队在捕获修复DNA过程中的聚合酶θ时取得了一个惊人的发现:每当聚合酶θ与断裂的DNA链结合时,它总是从四聚体转变为从未见过的二聚体结构。
DNA修复蛋白就像人体的编辑器一样,不断发现并逆转对人类遗传密码的损伤。长期以来,科学家们一直在努力了解癌细胞如何劫持其中一种叫做聚合酶θ(Pol theta)的DNA修复蛋白来生存。但是来自斯克里普斯研究所的研究人员如今首次捕捉到了聚合酶θ发挥作用的详细图像,揭示了导致一系列癌症的分子过程。相关研究结果发表在Nature Structural & Molecular Biology杂志上。
这些研究结果阐明了聚合酶θ在与断裂的DNA链结合时如何经历重大的结构重排。通过公布聚合酶θ与DNA结合在一起时的结构,该研究为设计更有效的癌症药物提供了蓝图。
论文通讯作者、斯克里普斯研究所教授Gabriel Lander说,“我们如今对Pol theta的工作原理有了更清晰的了解,这将使我们能够更精确地阻断其活动。”
从技术上讲,聚合酶θ是一种酶——一种加速化学反应的蛋白质,包括与细胞修复相关的化学反应。DNA损伤是细胞的一个持续问题,每天在我们的全身集体发生数百万次。细胞通常使用高度精确的机制来修复这些断裂,但一些癌症,特别是由BRCA1或BRCA2突变引起的癌症,如某些乳腺癌和卵巢癌,缺乏这种功能。相反,它们依赖于一种更容易出错的由聚合酶θ控制的方法。
论文第一作者Christopher Zerio补充道,“聚合酶θ是一个重要的靶点,许多制药公司认为它是治疗具有缺陷DNA修复途径的癌症的有前景的方法。”
尽管之前的研究已经绘制了聚合酶θ结构的一部分,但这种酶与DNA的相互作用尚不清楚。Zerio说,“我们缺少的是聚合酶θ实际上如何与DNA结合,这对药物开发至关重要。”
先前的研究表明,聚合酶θ以两种形式存在:四聚体(这个酶的四个拷贝)和二聚体(两个拷贝)。但聚合酶θ在这些形式之间变化的原因或方式尚不清楚。在这项研究之前,聚合酶θ的结构仅在非活性状态下被捕获,留下了关于这种酶如何与DNA相互作用的重大知识空白。Lander解释说,“你知道这种相互作用必须发生,但如果没有看到它,其机制仍然是一个谜。”
apo PolθH四聚体低温电镜结构与晶体结构的比较
通过低温电镜和生化实验,该团队在捕获修复DNA过程中的聚合酶θ时取得了一个惊人的发现:每当聚合酶θ与断裂的DNA链结合时,它总是从四聚体转变为从未见过的二聚体结构。
一旦处于活性状态,聚合酶θ就会使用两步过程修复DNA:首先,酶在断裂的DNA链上搜索称为“微同源序列(microhomologies)”的小匹配序列。一旦找到匹配的序列,聚合酶θ就会将断裂的DNA链连接在一起,这样它们就可以缝合在一起,而不需要额外的能量。大多数酶都需要能量增强才能发挥作用,但聚合酶θ依赖于匹配的DNA序列之间的自然吸引力,使它们能够自行就位。Zerio说,“如果我们能阻止这一过程,我们可以使依赖聚合酶θ的癌症对治疗更加敏感。”
重要的是,聚合酶θ在健康细胞中以低水平产生,使其成为癌症治疗的一个有前途的靶点。与癌细胞依赖聚合酶θ作为缺陷修复途径的解决方案不同,健康细胞依赖更精确的修复机制,需要能量来确保更精确的DNA修复。因为健康细胞不需要聚合酶θ来生存,所以阻断这种酶的活性可能不会对健康组织造成广泛的损害。
Lander指出,“大多数癌症药物都靶向健康细胞所需的蛋白。具体来说,靶向聚合酶θ只会杀死癌细胞,从而降低治疗过程中出现副作用的几率。”
抑制聚合酶θ的药物已经在临床试验中,但目前必须与其他疗法结合才能有效发挥作用。虽然这项研究可能为更精确的药物开发提供信息,但进一步的研究可能会揭示这种酶在细胞功能中发挥的其他作用。
Lander说,“我们还想了解为什么聚合酶θ以四聚体形式存在,以及它如何与其他DNA修复酶相互作用。这些见解可能会导致针对BRCA相关癌症的新方法。”(生物谷 Bioon.com)
参考资料:
Christopher J. Zerio et al, Human polymerase θ helicase positions DNA microhomologies for double-strand break repair, Nature Structural & Molecular Biology (2025). DOI: 10.1038/s41594-025-01514-8.
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