单细胞和空间转录组中环形RNA深度学习算法取得进展
CIRI-deep可以实现多种转录组测序数据中差异剪接环形RNA的可靠预测,并在单细胞及空间水平实现细胞类型特异环形RNA的准确解析,具有广泛的应用场景。
2024-02-21
Nature子刊:诸颖团队开发空间转录组语义注释新算法Pianno
在这项研究中,研究团队展示了Pianno在注释各种形状的解剖结构以及病灶和细胞类型方面的卓越性能,这些数据来自不同的空间技术平台。
2024-04-10
Neuron:骨转录因子或能控制神经系统中的基因表达
来自美国西北大学等机构的科学家们通过研究发现,一种已知的用于骨形成的关键转录因子或能支持中枢神经系统中的特化细胞,从而促进大脑组织硬化,这一发现或有望为开发神经元再生的新型疗法提供相关信息。
2023-12-19
Nature:揭示组蛋白修饰调节先锋转录因子协同性结合机制
就像紧紧缠绕在线轴上的线一样,DNA被包裹在组蛋白上,并被包装成称为核小体的结构。在一项新的研究中,来自美国圣犹达儿童研究医院的研究人员探索了一种被称为先锋转录因子(pioneer transcrip
2023-05-30
Cell:DNA引导的转录因子协同作用塑造了面部和肢体间充质
近段时间,来自斯坦福大学化学与系统生物学系的Seungsoo Kim教授及其团队通过比较人类和黑猩猩面部颅神经嵴细胞的增强子图谱,发现了其增减与增强子活性变化相关的图案,研究TF 协同结合的功能影响。
2024-01-29