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研究解析结核杆菌转录起始复合物的晶体结构

 基因组的遗传信息得以表达,首先需要RNA polymerase (RNAP)以DNA为模板合成RNA。基因转录不仅是基因表达第一步,还是基因表达的主要调控步骤。对RNAP分子机器结构、运行机理以及调控机制的研究能够回答基因表达调控的基础生物学问题。在转录起始阶段,细菌的RNAP与转录起始σ因子形成复合物,依次执行启动子双链DNA的识别、解链以及RNA起始合成等关键步骤。细菌RNAP通过

2019-03-14

《Nature》报道T细胞功能调控的关键转录因子

T细胞是适应性免疫系统的主要组成部分, 它们在病菌感染中被功能活化, 参与宿主防御, 但是遇到自身抗原或者在慢性感染和肿瘤微环境中, 它们会发生命运改变, 进入功能失能命运, 但是调控T细胞功能失能的分子机制会不清楚。本研究通过转录组及表观组学手段,发现功能缺陷的T细胞 [Dysfunctional T cell], 包括免疫耐受T细胞 [Tolerant T cell] 和慢性感染和肿瘤微环境导

2019-03-09

研究揭示干细胞分化关键转录因子

近期,国际学术期刊《细胞-干细胞》(Cell Stem Cell)在线发表了由中国科学院数学与系统科学研究院和美国斯坦福大学科研人员合作的干细胞分化的基因调控网络建模成果。这一成果提出了利用匹配的基因表达和染色质可及性数据刻画转录因子和调控元件结合调控下游基因表达的数学模型,构建了描绘细胞状态转化的染色质调控网络,通过网络分析鉴定出TFAP2C和p63分别为表面外胚层起始和角质形成细胞成熟的关键因

2019-03-03

研究揭示转录因子NIN在根瘤菌侵染时的关键作用

 2月1日,Plant Physiology 杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所、中国科学院-英国约翰·英纳斯中心植物和微生物科学联合研究中心(Center of Excellence for Plant and Microbial Sciences; CEPAMS)Jeremy Murray研究组题为NIN acts as a Network Hub

2019-02-25

效应性Treg细胞分化的转录调控研究中取得进展

 调节性T细胞(Treg)是具有免疫抑制功能的T细胞,其主要的功能是抑制效应T细胞介导的免疫反应及维持机体的免疫耐受。效应性Treg只占次级淋巴器官和外周循环Treg细胞的较少一部分,大多数分布于各种组织脏器,效应性Treg是一群已经接受过抗原刺激、活化程度比较高且具有较强的免疫抑制功能的Treg细胞,这群细胞能够快速迁移进入发生免疫反应的部位,发挥免疫抑制的功能,防止T细胞介导的免疫反

2019-02-21

Nat Commun:揭秘转录因子“勘察”细胞基因组的分子机制

2019年2月12日 讯 /生物谷BIOON/ --转录因子(TFs)是一种能调节基因表达的特殊蛋白,其能在完整的基因组中搜索并结合特殊区域来调节基因的表达;我们都知道,转录因子不仅能结合特殊的DNA序列,还能非特异性结合任何DNA链。这些非特异性的关联就能够明显增加转录因子寻找特殊靶点的能力,然而目前研究人员并不清楚在扫描大量基因组、定位以及结合特殊位点时,人类机体中超过1500种转录因子的的效

2019-02-12

研究揭示YWHA/14-3-3结合并调控转录因子TFEB功能的分子机制

国际学术期刊Autophagy 在线发表了中国科学院生物物理研究所冯巍课题组和杨福愉课题组合作的题为YWHA/14-3-3 proteins recognize phosphorylated TFEB by a noncanonical mode for controlling TFEB cytoplasmic localization 的研究论文,揭示了YWHA/14-3-3与转录因子TFEB结

2019-02-05

樟科植物比较转录组学研究获进展

 樟科植物在克朗奎斯特分类法中被分到木兰亚纲(Magnoliidae)中,被视为双子叶植物中比较原始的类群。这类植物的萼瓣不分,花瓣和萼片联合在一起,统称花被。樟科树种具有多种经济用途,许多种类的种子富含脂肪酸。然而,这一类群的遗传学与基因组学研究背景十分薄弱,目前仅有鳄梨(Persea americana)、山胡椒(Lindera glauca)和山鸡椒(Litsea cubeba)等

2019-01-12

Nat Chem Biol:利用转录因子诱饵激活沉默的生物合成基因簇

2019年1月6日/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自美国伊利诺伊大学的研究人员在链霉菌中引诱抑制沉默基因表达的阻遏分子离开,从而成功地揭示出几个大型的处于沉默状态的基因簇产生新的天然产物。相关研究结果于2018年12月31日在线发表在Nature Chemical Biology期刊上,论文标题为“Activation of silent biosynthetic gene clus

2019-01-06

研究发现调控植物抗铝毒转录因子STOP1稳定性的机制

 12月17日,国际学术期刊《美国国家科学院院刊》(PNAS)在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所上海植物逆境生物学研究中心黄朝锋研究组完成的题为F-box protein RAE1 regulates the stability of the aluminum-resistance transcription factorSTOP1 in Arabidops

2018-12-24