研究人员开发出定量蛋白质组学数据的下游分析与可视化工具
基于超高分辨率液质联用质谱的定量蛋白质组学已成为重要的生命科学研究手段。与其他组学方法一样，恰当的数据分析流程是蛋白质组学研究的关键。基于质谱的蛋白质组数据具有方法仪器多样、搜库定量软件繁多的特点，导
多层级的图神经网络推动蛋白质功能预测的发展
高通量测序的进展推动了蛋白质序列数量的快速增长。尽管如此，由于实验研究需要较长的周期并且费用昂贵，大部分蛋白质序列缺乏功能注释。因此，具备自动而准确推断蛋白质功能的计算方法变得至关重要。
科研人员开发基因编码的光控蛋白质标记新技术
邹鹏课题组利用RinID技术系统研究了多个亚细胞区域的蛋白质组，包括线粒体、内质网、细胞核等，均获得了出色的空间特异性（>90%），高于目前常用的APEX2、TurboID等技术。
Cell Systems封面论文：曾坚阳团队提出蛋白质口袋结构表征新方法
具体而言，对于输入的蛋白质结构，首要任务是确定其表面上anchor的位置。这些anchor位置是通过对蛋白质表面潜在结合配体的空间区域进行采样、过滤、聚类等操作后得到的。
肿瘤新纪元：从基因组学向蛋白质组学再次跃进
泛癌症研究的重点是确定不同癌症的分子特征。该研究扩展了之前以基因组学为中心的泛癌症研究，结合蛋白质组学层来阐明癌症驱动因子的六个关键方面
Cell：借助于噬菌体辅助进化和蛋白质工程，华裔科学家构建出更紧凑更高效的新型先导编辑器
先导编辑（prime editing）技术使得科学家们能够以多种方式精确编辑基因组，有朝一日可用于治疗遗传疾病。如今，在一项新的研究中，来自美国布罗德研究所的研究人员利用最先进的实验室连续进化和工程方
研究发现全新蛋白质修饰类型
细胞代谢为生命过程提供能量。同时，代谢物可共价修饰蛋白质来发挥信号传导功能。虽然许多代谢物在代谢通路中的作用广为人知，但它们介导细胞信号调控的功能有待探索。酮体（包括丙酮、乙酰乙酸和β-羟基
研究人员建立定量测定离子束对细胞切片中蛋白质的损伤新方法
较体外纯化的蛋白质，在细胞中处于工作状态的蛋白质机器具有更为完整和生理的构象。因此，在细胞环境中直接对蛋白质机器进行三维结构解析是结构生物学的下一个目标，也是冷冻电镜技术发展的前沿。而利用冷冻电镜研究
从头设计蛋白质药物，这家生成式AI制药公司获英伟达认可，已完成近7亿美元融资，1款抗体药开始临床试验
Generate : Biomedicines 是一家基于人工智能技术的公司，但他们一直尊重实验生物学，实际上，该公司从事湿实验的科学家与从事干实验的科学家一样多。
Cell子刊：邹鹏团队报道基于荧光成像的蛋白质定向进化方法
由于Faculae方法能够在哺乳动物细胞中高效构建突变体文库，并在显微镜下鉴定细胞表型并快速选择细胞，该方法为进化荧光探针、化学遗传学元件和光遗传学元件等蛋白质工具提供了新思路。