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MIT团队提出蛋白生成新模型,无需预训练,可从头生成新蛋白质,主链长度可达500个氨基酸序列

近日,麻省理工学院的研究人员开发出了一种扩散模型 FrameDiff,这是一种生成式深度学习工具,能够生成自然界中不存在的新型蛋白质结构。在研究中,研究团队将 FrameDiff 应用于蛋白质主链生成

2023-07-24

Cell:利用TransitID动态绘制活细胞内和活细胞间的蛋白质组转运

我们DNA中的遗传计划通过蛋白实现了功能,而蛋白是我们身体结构和活动的基础。然而,蛋白质组---细胞或特定区域内的所有蛋白---仍然是相对神秘的,因为蛋白景观是非常复杂的。例如,人类制造了数以万计的不

2023-07-09

Cell:开发新型邻近蛋白质组学技术,第一作者秦为已回国加盟清华大学

大城市内的地铁线路错综复杂,每天不同的人会从一个站点通勤到另一个站点,承担着自己的社会责任。细胞内的蛋白质在时间和空间等维度上也是高度动态的,很多蛋白会在不同的细胞器之间甚至是不同的细胞之间进行转运和

2023-07-03

麻省理工团队开发类ChatGPT模型,基于蛋白质大语言模型,加速AI药物发现

开展一个药物筛选项目就像举办一场大型酒会,并旁听和记录整个过程。在酒会上的绝大多数交流只是闲聊,有意义的谈话只占极少数。药物筛选同样如此,微弱的药物靶标相互作用远超高亲和力的结合。

2023-06-16

Nature子刊:杨弋团队开发出活细胞蛋白质光遗传学控制技术

该研究随后利用SULI调控酵母细胞内源蛋白SicI的稳定性,实现酵母细胞周期的精确控制。此外,SULI还可用于调控斑马鱼中蛋白质的稳定性,通过对Pitx2蛋白稳定性的调控

2023-05-03

Nature:新研究解析出参与基因组编辑蛋白质的3D结构

在一项新的研究中,该团队发现了一种名为TnpB的蛋白的三维结构,它可能是CRISPR-Cas12酶的前体。相关研究结果发表在2023年4月13日的Nature期刊上。

2023-04-27

Dev Cell:张宏团队揭示蛋白质能以“表面活性剂”方式调控基因转录

该研究表明转录因子凝聚体的界面张力与其转录活性密切相关,细胞中的天然蛋白质可能以表面活性剂方式调控转录因子凝聚体的界面张力及转录活性,进而调控相关通路的活性。

2023-05-01

Cell Res:季勇/陈宏山团队等发现中心法则重要补充,蛋白质信息可直接逆向改变自身RNA编辑

该研究首次提示,蛋白信息可以直接逆向反馈改变自身RNA功能状态,对中心法则过程进行补充。进一步研究将注重是否存在更多种蛋白质的不同变构方式亦可以影响自身RNA,同时期望在更多的生理病理状态下验证这一机

2023-05-19

专家研发出“钓鱼式”生物标志物检测技术,可实现单分子级别蛋白质检测!

该团队首次将纳米孔技术与抗体模拟技术相结合——粘附在纳米孔上的人工蛋白质支架能够像抗体一样,与特定的生物标志物结合并相互作用。在针对不同目标蛋白质时,仅需要改变粘合剂的一小部分,因此,这解决了以往传感

2023-05-04