Mol Cell:HOXDeRNA 通过与基因组广泛结合激活癌症转录程序和超级增强子
HOXDeRNA通过rG4结构结合EZH2并招募到PRC2标记的基因组区域,从而去除PRC2对关键胶质瘤转录因子和超级增强子的抑制,最终激活多个癌症驱动基因,驱动星形胶质细胞向胶质瘤转化。
2024-11-07
Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱,CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化
CalicoST算法的诞生填补了这一空白。它不仅能够从空间转录组数据中推断出肿瘤的等位基因特异性拷贝数变异,还能够重建肿瘤克隆在空间中的进化轨迹,绘制出肿瘤演化的“进化地图”。
2024-11-10
Nat Cell Biol:赵方庆团队开发基于编程控制的转录组实时测序新技术
该研究首次提出了转录组智能测序的概念,依托人工智能纳米孔自适应测序算法,能够实时判断测序分子来源,并可编程选择目标测序分子进行全长测序。
2024-11-03
Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱:CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化
CalicoST算法的核心优势在于其能够从SRT数据中精确推断等位基因特异性拷贝数变异(allele-specific CNAs)。
2024-11-23
研究揭示人类PIWI蛋白的结构和机制特征
在该研究中,研究人员成功分离了小鼠和人的PIWI蛋白MILI和HILI,解析了它们与靶标RNA的结合和非结合状态的结构,并进行了生化分析。
2024-06-01
Nature | 大规模结直肠癌基因组研究:寻找预后突变与治疗靶点
这项研究实现了迄今为止最大规模的结直肠癌基因组和转录组的综合分析,并将分子层面的发现与高质量的临床数据相结合,从而识别关键预后因子,这使这项研究有别于其他绝大多数癌症基因组学的研究。
2024-08-09
Nature:计算蛋白质设计,AI如何重塑生物学的未来
2024-11-15
丽莎病毒属M蛋白抑制NLRP3炎症小体活化机制
狂犬病病毒(RABV)是丽莎病毒属的重要成员之一,是一种典型的嗜神经病毒,其需要从外周的感染部位逆轴突传输至中枢神经系统(CNS),最终在CNS大量复制导致机体发病死亡。
2024-07-31
蚊子的唾液蛋白如何操控人体免疫系统加剧病毒传播?Sci Immunol揭秘:蚊子唾液中的特殊蛋白Nest1或能抑制宿主机体的免疫反应
CD47 是一种位于许多细胞表面的特殊免疫受体,它控制着多种免疫过程,包括保护某些细胞以及激活其他细胞。
2024-08-23
Nat Methods | 田鲁亦/刘晓东团队系统性评估11种空间组学技术
通过评估,不同技术方案各有优劣,并且一些国产的技术平台的指标已经达到领先,凸显了中国在这一新兴领域的快速发展趋势。
2024-07-16