国内首个菊花脑基因组测序-纳米孔测序再发高分论文
菊属植物种类繁多,又含多种栽培种,兼具观赏和药用价值,且染色体组结构从2n=18到8n=72之间,十分复杂,多年来难以攻破。中药所所长陈士林研究员、副研究员宋驰博士等利用ONT平台解析了可能代表栽培菊属祖先基因组的二倍体菊花脑基因组,分析表明其演化受重复序列爆发和近期WGD事件的驱动,该基因组复制事件在约38.8个百万年前将菊属和向日葵分化开来;菊花脑观赏及药用性状的变异与
纳米孔“ARMA”分析工作流——实时检测抗生素抗性基因
据世界卫生组织报道:“抗微生物药物耐药性(AMR) 是一种全球性的公共卫生危机,将会严重危害现代医学的发展”。纳米孔读长已作为一项独立工具或作为混合测序方法的一部分,成功应用于抗微生物药物耐药性分析,以帮助处理复杂的重复区域。除此之外,我们还开发了能够实时进行微生物鉴定和抗微生物药物耐药性分析的“ARMA”分析工作流,能够突出显示表明给定抗生素耐药性的比对,且不需要全面深入的生物信息学
6小时识别病原菌的纳米孔宏基因组学方案
近日,英国东安格利亚大学的Justin O'Grady博士和Earlham研究所的科学家成功开发了一种宏基因组学检测的研究方法。该优化后的研究方案针对细菌性下呼吸道感染,可从临床呼吸道样本中去除高达99.99%的宿主核酸,并利用纳米孔测序的实时检测在6小时内准确识别病原体和抗生素抗性基因。《Nature Biotechnology》杂志7月以封面文章的形式刊登了该项研究。细菌性下呼吸道
纳米孔测序实现对人体肠道微生物组中抗性决定因子和移动元件的高分辨率分析
微生物组学的研究——即给定样本中所有微生物的遗传物质的研究最近引起了相当大的关注,而这主要是因为人们认识到我们身体和环境的微生物的组成会对我们的健康产生深层影响。肠道微生物是人体代谢的重要参与者,拥有丰富的微生物群落,数万亿的细菌同时存在,并通过饮食和偶尔的抗生素选择,创造了一个抗生素抗性基因很容易在细菌物种之间转移的动态环境。随着多重耐药性生物体的普遍存在,其中许多生物体在质粒上携带
华大智造国产基因测序仪全球装机量再创新高
2019年1月6日,美国加州,China Focus @JP Morgan week,华大智造首席运营官蒋慧博士宣布华大智造国产基因测序仪全球装机量突破1000台,已在全球16个国家获得使用,累计产生的运行数据达20Pb。华大测序仪在全球基因测序行业发挥着越来越重要的作用。韩国LAS实验室主任金东浩博士从事着基因组学研究和基于NGS的临床诊断应用开发,日前,他的实验室安装了华大智造的第1000台测
纳米孔测序技术发展简介
随着对DNA结构和序列的研究,DNA测序技术不断发展,成为生命科学研究的核心领域,对生物、化学、电学、生命科学、医学等领域的技术发展起到巨大的推动作用。利用纳米孔研究出新型的快速、准确、低成本、高精度及高通量的DNA测序技术是后人类基因组计划的热点之一。纳米孔测序技术发展简介纳米孔检测技术作为一个新型平台,具有低成本、高通量、非标记等优势,可将基因组测序的成本降
国家明确国产高通量基因测序仪加速进院
2018年4月11日,国家发改委等8部委联合发布《关于促进首台(套)重大技术装备示范应用的意见》(发改产业〔2018〕558号),一个将极大利好国产创新医疗设备走入政府招标采购、走进公立医院的重要文件,终于出炉了。1、扶持首台套装备,国家政策一再升级为了推动中国制造的创新发展,党和国家陆续出台了很多政策,做了很多事。在医疗器械领域,典型的就是各种科技和研发专项,医疗器械的特别审批和优先审批等。然而
科技部部长万钢实地指导国产第三代基因测序仪产业化工作
11月16日下午,全国政协副主席、科技部部长万钢在广东省委常委、深圳市市委书记王伟中、南方科技大学校长陈十一的陪同下,实地指导了国家重点研发计划、南方科技大学研发并由深圳市瀚海基因生物科技有限公司孵化的高科技成果第三代基因测序仪的产业化工作。万钢部长来到南方科技大学,听取第三代基因测序仪研发团队负责人、“**计划”特聘专家、瀚海基因公司董事长贺建奎的情况汇报。贺建奎说:“第三代基因测序
我国自主研发第三代基因测序仪成功用于NIPT
近日,由南方科技大学、中国科学院北京基因组研究所、浙江大学医学院附属妇产科医院(以下简称“浙大妇产科医院”)等多家单位联合完成的“第三代单分子测序仪的无创产前检测研究”结果显示,使用我国完全自主研发的第三代单分子基因测序仪,可成功应用于无创产前检测(英文简称NIPT),且检测结果100%准确。相关研究成果已发表在由非营利机构美国冷泉港实验室运营的BioRxiv网站上。“这是世界上首次利用单分子测序
我国自主研制可量产第三代基因测序仪在深面世
基因测序的“100美元时代”何时来临?第三代基因测序仪实现全国产还要多久?7月31日,南方科技大学孔雀团队的一场成果发布会给出了这两个问题的答案:现在。当天上午,南京科技大学生物系副教授、瀚海基因董事长贺建奎带领团队自主研发的第三代基因测序仪GenoCare在深圳市民中心面世。贺建奎介绍说,GenoCare是目前全球准确率最高且唯一一款应用于临床的第三代基因测序仪,其技术水