单细胞和空间转录组中环形RNA深度学习算法取得进展
CIRI-deep可以实现多种转录组测序数据中差异剪接环形RNA的可靠预测,并在单细胞及空间水平实现细胞类型特异环形RNA的准确解析,具有广泛的应用场景。
2024-02-21
空间组学技术破译阿尔茨海默病的重要风险因子!Mol Psych:首次实现在单细胞水平上对TREM2 R47H遗传变异影响的深度解析
此项研究首次以如此精细的尺度全面审视大脑,使得研究者能更深入理解TREM2 R47H突变对特定细胞类型中基因表达的影响。
2024-08-14
李程/孙育杰/黄粤团队揭示异倍体对染色质空间结构和转录组的影响
本研究结合Hi-C、RNA-seq、染色体成像和新生RNA成像技术,探究了异倍体ESC相比正常二倍体ESC在染色质三维结构和基因转录层面的变化。
2024-04-12
iScience:施一公团队系统总结电磁辐射与生物系统之间的相互作用
研究团队使用完全组装的试验台原型机进行了生物电磁实验,通过24小时的细胞恒温培养,未观察到细胞有明显缺陷,验证了该原型机对细胞系的生物相容性。
2024-03-08
Signal Transduct Target Ther | 苏州大学胡士军/沈振亚等合作:中国空间站上的第一项宇宙生物学研究
研究团队指出,hiPSC衍生的心肌细胞(hiPSC-CMs)可以模拟微重力对人类心脏的影响,并在国际空间站上的太空飞行期间发现了细胞水平上的钙处理和基因表达的变化。
2024-04-19
Nat Mater | 陈小元/杨震/晁洁通过DNA折纸技术,在空间上控制CD95信号诱导类风湿关节炎的免疫耐受
该研究描述了一种利用可编程DNA折纸来调节炎症滑膜组织中活化免疫细胞的CD95诱导死亡信号的策略,以建立局部的RA逆转免疫耐受。
2024-04-14
Nature Methods | 复旦大学原致远/中国科学院赵屹合作为空间聚类方法提供了一个全面的评估框架
该研究比较分析发现了当前方法的几个局限性,包括识别小区域的挑战,缺乏多切片分析能力和大规模可扩展性问题。
2024-03-20
空间几何约束诱导细菌与宿主细胞粘附的力学生物学机制研究方面取得新进展
该研究不仅阐明了空间几何约束微环境调控细菌-细胞界面粘附的力学生物学机制,也为抗生素辅剂的筛选和临床上改善细菌抗生素治疗方案提供了可借鉴的思路和策略。
2024-02-15