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Cell:开发出一种称为 Open-ST 的空间转录组学平台,能够三维重建组织内细胞中的基因表达

Open-ST 提供了一种高性价比、高分辨率、易于使用的方法,可同时捕捉组织切片的组织形态和空间转录组学信息。连续的二维图谱可以对齐,可将组织重建为三维“虚拟组织块”。

2024-07-15

多篇文章解读科学家们在空间多组学研究领域取得的新进展!

革命性算法BANKSY或能重塑空间组学数据分析、单细胞和空间转录组中环形RNA深度学习算法取得重大进展、综述文章揭示单细胞和空间组学技术在肝脏研究领域的重要进展

2024-04-30

Nature Genetics | 揭示肺纤维化新视界:从小鼠到人的空间转录组学描绘特发性肺纤维化(IPF)病理机制

该研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术,详细描绘了IPF和小鼠肺纤维化模型中的细胞相互作用和信号传导途径,揭示了关键的趋同和分歧路径。

2024-07-04

Cell:新研究构建出肠道细胞的空间图谱,并在肠道炎症过程中追踪它们的轨迹

在以前的研究中,IAF已在癌症和自身免疫性疾病等多种疾病中观察到,因此了解IAF的作用和机制可能有助于开发治疗这些疾病的方法。

2024-04-22

Nature Genetics | BANKSY:革命性算法,重塑空间组学数据分析

随着生物技术的快速发展,空间组学数据的产出呈现爆炸式增长,传统的数据分析方法已难以满足研究的需求。BANKSY算法的开发旨在解决这一问题。

2024-03-05

空间组学技术破译阿尔茨海默病的重要风险因子!Mol Psych:首次实现在单细胞水平上对TREM2 R47H遗传变异影响的深度解析

此项研究首次以如此精细的尺度全面审视大脑,使得研究者能更深入理解TREM2 R47H突变对特定细胞类型中基因表达的影响。

2024-08-14

【报名倒计时】2024空间多维组学创新转化研讨会,4月12日上海开幕!

“2024空间多维组学创新转化研讨会”,将于4月12日在上海召开!诚邀国内多位科学家、临床专家和行业专家分享各自领域的空间多组学应用及研究进展,探讨与推动医学领域的创新转化。

2024-04-01

单细胞和空间转录组中环形RNA深度学习算法取得进展

CIRI-deep可以实现多种转录组测序数据中差异剪接环形RNA的可靠预测,并在单细胞及空间水平实现细胞类型特异环形RNA的准确解析,具有广泛的应用场景。

2024-02-21

李程/孙育杰/黄粤团队揭示异倍体对染色质空间结构和转录组的影响

本研究结合Hi-C、RNA-seq、染色体成像和新生RNA成像技术,探究了异倍体ESC相比正常二倍体ESC在染色质三维结构和基因转录层面的变化。

2024-04-12

Science | 北京大学胡家志团队解析哺乳动物DNA复制叉的空间构型

该研究开发了DNA复制相关的原位HiC (Repli-HiC)试验来研究涉及复制叉的染色质相互作用。

2024-03-16