《细胞》亮点：庄小威联合团队看清染色质转录动态；单细胞测序揭示肺癌难根治原因
顶尖学术期刊《细胞》在线发表了多篇论文。第一篇论文来自哈佛大学庄小威教授与Bogdan Bintu教授的联合团队。科学家们开发了一种全基因组范围内的成像技术，能够看清染色质的3D结构与转录活性。研究人员们在摘要中指出，染色质的3D结构调控了许多基因组的功能。如果有一款工具能够看清染色质的3D结构，无疑将帮助我们更好地理解其生理功能。为此，研究人员
研究人员发表中性粒细胞稳态和炎症状态下的单细胞发育和异质性图谱
2020年7月27日，北京大学生命科学学院李程研究组与哈佛大学医学院罗鸿博研究组、中国医学科学院血液学研究所马凤霞课题组合作在Nature Immunology杂志发表了题为“Single-cell transcriptome profiling reveals neutrophil heterogeneity in homeosta
Nature Communications：研究发表单细胞转录组数据检索新方法和参考数据库
作为细胞异质性研究的重要工具，单细胞转录组测序技术近年来蓬勃发展，并积累了大量研究数据。若能有效利用现有的单细胞数据进行检索与推断，研究者便能更好地进行新测序单细胞的注释，以及综合多数据集的研究。然而，精确的单细胞转录组数据检索和注释需要克服两个挑战：一、数据集之间的批次效应（batch effect）会显着影响细胞检索的可靠性；二、目前缺少跨物
Nat Med：揭示重症COVID-19患者外周免疫反应的单细胞图谱！
2020年6月日讯 /生物谷BIOON /——2019冠状病毒病(COVID-19)是由SARS-CoV-2引起的全球大流行，目前全球已有接近800万人感染，迫切需要进一步了解其病理生理学特征。约20%的COVID-19患者发展为严重疾病，5%的患者需要重症监护。严重的疾病与外周免疫活动的改变有关，包括促炎细胞因子的增加，这可能是由炎症单核细胞、淋巴球减少症
Nat Biotechnol：科学家发现能准确高效进行单细胞转录组特性分析的最佳技术—Quartz-seq2
2020年4月9日 讯 /生物谷BIOON/ --为了确保单细胞RNA测序能够使用最好的方法，日前研究人员对13种方法进行了基准性的测试，一项刊登在国际杂志Nature Biotechnology上的研究报告中，来自西班牙的科学家们通过研究发现，日本理化所开发的Quartz-seq2方法或许是进行单细胞RNA测序的最佳手段。图片来源：CC0 Public D
Nature：浙江大学领衔在构建全面的人类单细胞图谱方面取得重大进展
2020年3月31日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，来自中国浙江大学等研究机构的研究人员朝构建全面的人类单细胞图谱迈出了一大步。相关研究结果于2020年3月25日在线发表在Nature期刊上，论文标题为“Construction of a human cell landscape at single-cell level”。在这篇论文中，他们描
Nature：首个系统性癌症基因组图谱问世——揭示癌细胞演化之谜
近日，《Nature》杂志在线发表了由EMBL-EBI领导的一系列新研究，即系统性癌症全基因组分析项目。该项目参与机构包括惠康桑格研究所，麻省理工学院，哈佛大学，牛津大学大数据研究所以及俄勒冈州健康与科学大学等。
Nat Genet：首个系统性癌症基因组图谱问世——揭示癌细胞中存在病毒DNA元件
在最近发表在自然旗下（包括《Nature》、《Nature Genetics》，《Nature Communications》在内）杂志上的一系列文章中，来自国际上的多个研究团队系统性地研究了来自38种不同类型癌症患者体内的2,600多个肿瘤样本中的DNA。
Science：对人类血细胞中的所有蛋白编码基因进行全基因组转录组分析
2019年12月31日讯/生物谷BIOON/---在临床和研究环境中，血液都是对人类进行分子分析的主要来源，并且是许多治疗策略的目标，这突显了需要对构成人类血液的细胞进行全面的分子图谱构建。人类蛋白质图谱计划（www.proteinatlas.org）是一个开放式数据库，旨在通过整合各种组学技术（包括基于抗体的成像）来绘制所有人类蛋白的图谱。以前，人类蛋白质
研究开发单细胞空间转录组数据分析可视化平台
单细胞测序技术是一种在单细胞水平上对基因组、转录组、表观组等进行高通量测序分析的技术。单细胞测序技术能够在组学水平揭示细胞间的异质性。单细胞水平细胞谱系追踪技术位居2018年Science 杂志评选的十大科学突破之首。常规单细胞转录组测序技术丢失了细胞在原组织中至关重要的空间位置信息，而单细胞空间转录组技术在进行单细胞转录组测序的同时保留并记录了细胞的空间位置信息。空间转录组技术能够揭示细胞间的相