宏基因组测序(mNGS):病原微生物检测新风口
基于宏基因组新一代测序技术(metagenomics next generation sequencing, mNGS) 不依赖于传统的微生物培养，直接对临床样本中的核酸进行高通量测序，能够快速、客观的检测临床样本中的多种病原微生物（包括病毒、细菌、真菌、寄生虫），尤其适用于急危重症和疑难感染的诊断。随着mNGS 技术平台的完善和临床研究的增多，mNGS在临床上的运用将越来越广泛。
研究人员解译出真盐生植物异子蓬全基因组
异子蓬（Suaeda aralocaspica）是一年生真盐生植物，主要分布于中亚，在中国仅产于新疆。异子蓬在耐盐特性、光合作用和种子性状等方面具有重要的研究价值。异子蓬能够在表层土壤含盐量超过10%的环境中正常生长，种子萌发耐盐性超过1000mmol/L NaCl。异子蓬的叶片、花被片和果实都能在单个细胞内完成C4光合作用，这与典型的具有花环结构(Kranz)的C4植物不同。另外，异子蓬能在同一
Cell：发现一种将癌症进展与基因组不稳定性关联在一起的新型生物标志物
2019年1月24日/生物谷BIOON/---我们的DNA经常受到攻击。这种含有我们的遗传信息的分子极易受到从环境因素（如辐射）到我们呼吸的空气和我们吃的食物中的化学物的一切东西的影响。基因组不稳定性可导致遗传疾病、慢性疾病和癌症易感性。在一项新的研究中，来自以色列特拉维夫大学的研究人员确定一种称为ubiquilin-4的蛋白水平升高成为基因组不稳定性的一种新的生物标志物。他们发现ubiquili
真核生物基因组周期性竟由突变导致
2018年11月11日/生物谷BIOON/---自从21世纪初人类、小鼠和果蝇等生物的基因组序列为人所知以来，一些科学家们就已注意到由腺嘌呤（A）和胸腺嘧啶（T）组成的碱基对在基因组中的比例具有明显的周期性。事实上，在基因组中，每隔10个碱基对观察到A/T碱基对存在的几率就会增加。这种周期性与DNA缠绕核小体的方式有关。科学家们给出的解释是自然选择有利于A/T碱基的出现，这些因为这两种碱基为DNA
两篇Nature论文聚焦英国生物样本库中的基因组和表型数据
2018年10月13日/生物谷BIOON/---两个研究团队独立地在Nature期刊上发表两篇论文，描述了使用英国生物样本库（UK Biobank）中的全套数据开展的研究。第一个研究团队由来自英国、澳大利亚和瑞士的研究人员组成---他们搜索了英国生物样本库，从中寻找遗传变异和表型之间的关联性，以便填补这些数据中的空白。第二个研究团队由牛津大学的研究人员组成---他们使用英国生物样本库旨在将遗传数据
猕猴桃多重高效基因组编辑系统研究取得进展
猕猴桃因其丰富的营养价值和独特的风味而成为重要的全球性新兴水果。随着我国及世界猕猴桃产业的发展，如何快速高效地创制优异特色新种质并培育新品种，成为制约产业发展的关键。目前，基于成簇规律间隔短回文重复序列/成簇规律间隔短回文重复序列关联蛋白（clustered regularly interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associate
《Nature》超越微生物全基因组关联研究 寻找肠道微生物与疾病的真正关联
哈佛医学院的小鼠研究为寻找肠道微生物与疾病之间的因果关系铺平了道路 我们也许对“全基因组关联研究（GWAS）”这个名词并不陌生——对于某种疾病而言，当比较足够多的患病与不患病人群基因组后，有可能就可以找到与疾病相关的遗传变异。这也是全基因组关联研究背后的理论基础，自第二代基因组测序技术兴起之后，十多年来，科学家们正在利用GWAS寻找包括精神分裂症和类风湿性关节炎等在内的疾病遗传基础。但是
Cell：新技术允许更加精确地开展多重基因组编辑
图片来自Cell, doi:10.1016/j.cell.2017.10.034。2017年11月18日/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，来自美国耶鲁大学的研究人员构建出一种更加精确的和高效的技术来对活的有机体的基因组进行编辑。这种新的方法会消除基因组编辑技术的一些缺点，这能够让科学家们插入或清除DNA中的基因。这一成果正在引发医学和生物技术变革。相关研究结果于2017年11月16日在线
研究发现真核基因组更像“一窝社会性昆虫”
传统上，基因组被喻为一本书，即“生命之书”，主要是指蛋白质编码DNA贮藏遗传信息、能够被转录和翻译为蛋白质的功能。然而，随着人类和越来越多其他高等生物基因组的完成，人们渐渐认识到将基因组比喻为书可能有点不合适了。龙岩学院生命科学学院教授邱国华等经过多年研究后将其比喻为“一窝社会性昆虫”。近日，相关文章发表于国际期刊《表观基因组学》。非编码DNA是“保镖”邱国华等人认为，基因组有别于一本
培训班丨美吉生物微生物基因组生信培训班开始报名
主办单位：上海美吉生物医药科技有限公司培训时间地点：2017年11月27日-12月1日；美吉生物总部 上海 培训特色：1. 小班教学，一对一辅导，手把手教会； 2. 资深讲师，丰富的项目经验和授课经验； 3. 理论+上机操作，生信分析So easy； 4. 一次学习终生受用， 享受课堂面对面教授，还有无限期在线培训学习； 5