Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱:CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化
CalicoST算法的核心优势在于其能够从SRT数据中精确推断等位基因特异性拷贝数变异(allele-specific CNAs)。
2024-11-23
Genome Biol:杨力组开发基于深度学习的计算分析框架实现RNA测序数据直接鉴别RNA编辑与DNA突变位点
DEMINING框架通过嵌入的深度学习模型DeepDDR,实现了从RNA测序数据中高效、精确地鉴定RNA编辑和DNA突变。
2024-10-16
Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱,CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化
CalicoST算法的诞生填补了这一空白。它不仅能够从空间转录组数据中推断出肿瘤的等位基因特异性拷贝数变异,还能够重建肿瘤克隆在空间中的进化轨迹,绘制出肿瘤演化的“进化地图”。
2024-11-10
Mol Cell:HOXDeRNA 通过与基因组广泛结合激活癌症转录程序和超级增强子
HOXDeRNA通过rG4结构结合EZH2并招募到PRC2标记的基因组区域,从而去除PRC2对关键胶质瘤转录因子和超级增强子的抑制,最终激活多个癌症驱动基因,驱动星形胶质细胞向胶质瘤转化。
2024-11-07
西湖大学高晓飞团队开发红细胞-MHC-I偶联药物,用于癌症治疗
这项研究首次证明,仅带有抗原肽-MHC-I复合物的红细胞就可以有效地刺激免疫系统,为癌症治疗提供了一种有前途的新型临床策略。
2024-10-11
《细胞》子刊:这些癌症,年轻人发病风险高25倍!首医团队分析千万国人数据,发现肥胖相关癌症发病率飞升、年轻人深受其害
1997-2001年出生的年轻人,相较1962-1966年出生的老年人,患上肥胖相关癌症的风险高达25倍。
2024-09-08
Nature:新研究首次发现胚胎细胞收缩驱动人类胚胎形成最初的形状
研究人员发现人类胚胎压实(embryo compaction)是胚胎发育最初几天的一个重要步骤,是由胚胎细胞的收缩驱动的。
2024-05-08
Nature:双重免疫检查点抑制加化疗对携带KEAP1/STK11突变的转移性非鳞状NSCLC患者有益
这些发现证明,携带STK11或KEAP1突变的NSCLC患者对PD-(L)1抑制剂和化疗的标准组合相对耐药,但如果在治疗方案中加入CTLA-4抑制剂,他们就能明显获益。
2024-10-22
《科学·进展》:天津医科大团队揭示驱动胰腺癌干性和化疗耐受性的新机制,饮食干预或可破解!
对100多例PDAC组织样本进行分析发现,BICC1能够帮助PDAC细胞维持癌症干细胞特征,上调与干性相关的基因,增强成球能力等干细胞特性。沉默BICC1会导致癌症干细胞的占比大幅降低。
2024-07-07