Nat Methods：新技术能够准确指征肠道微生物的起源
2019年6月13日 讯 /生物谷BIOON/ --加州大学洛杉矶分校领导的研究团队已经开发出一种更快，更准确的方法来确定人体中许多细菌的来源。从广义上讲，该工具可以推断出任何微生物组的起源。与需要数天或数周的工具相比，新的计算工具“FEAST”可以在短短几个小时内分析大量遗传信息。该软件程序可用于医疗保健，公共卫生，环境研究和农业。该研究在线发表在《Nature Methods》上。微生物组通常
分子物种定界研究取得进展
近日，中国科学院数学与系统科学研究院科研人员在分子物种定界方面取得新进展，其成果发表在生物系统学杂志Systematic Biology上。该项工作与加州大学戴维斯分校、西雅图大学合作完成，数学院博士朱天琪和海外科学家杨子恒分别是第一作者和通讯作者。物种定界是分类学最基本的问题，基于贝叶斯模型选择方法的BPP软件是最为广泛使用的分子物种定界软件。一些对贝叶斯物种定界的模拟研究认为BPP软件检测到的
研究揭示生物炭负激发效应的微生物关键物种竞争作用机制
土壤是全球碳循环的重要碳库，土壤有机碳封存可以缓解大气中CO2浓度的升高并提高土壤肥力。生物炭应用已被广泛证实是一种有效促进土壤有机碳封存和提高产量的方法（Woolf et al.， Sustainable biochar to mitigate global climate change， Nat Commu， 2010），但是目前关于生物炭对土壤有机碳激发效应的生物学机制尚不清楚。通常认为生物
Science：新研究揭示神经多样性的起源
2019年5月10日 讯 /生物谷BIOON/ --皮层是一个复杂的大脑区域，它使我们能够感知世界并与周围的物体和生物相互作用。它可以执行的任务的多样性反映在组成它的神经元的多样性中。实际上，在胚胎发生过程中，几十种具有不同功能的细胞类型聚集在一起，形成了无数的电路，形成了我们思想和行动的基础。这些神经元是从祖干细胞中产生的，祖细胞干细胞一个接一个地分裂和产生这些不同的细胞类型。但是，这些祖细胞如
Cell：迄今为止最大规模人体微生物组研究揭示出数千种新型微生物物种
2019年3月31日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，来自意大利特兰托大学计算宏基因组学实验室的Nicola Segata、Edoardo Pasolli及其团队创建出一个迄今为止最大规模的普遍存在于世界各地人体中的细菌和古细菌目录。相关研究结果近期发表在Cell期刊上，论文标题为“Extensive Unexplored Human Microbiome Diversity Reve
植物种子大小研究综述发表
植物种子大小是重要的产量性状，种子大小的调控也是重要的发育生物学问题。因此，解析种子大小调控的分子机制，可以为作物的高产育种提供理论基础和基因资源。近年来植物种子大小的调控机制研究进展迅速，目前已成为植物领域研究的热点和前沿。中国科学院遗传与发育生物学研究所李云海研究组长期致力于植物种子大小调控的机理研究，已在水稻和拟南芥中分离了一系列种子大小调控的关键因子，发现了多个种子大小调控途径
New Phytologist：基于CRISPR技术可以标记多物种的基因组
2019年3月9日 讯 /生物谷BIOON/ --自2012年提出其机制以来，CRISPR / Cas9系统一直在科学界引起涟漪。许多科学家已经发现了Cas9蛋白的剪刀样特性的不同应用。最近，来自莱布尼茨植物遗传和作物植物研究所（IPK Gatersleben）的研究人员现在已经找到了一种以稍微不同的方式利用RNA /蛋白质复合物的方法。除了传统的原位杂交外，新的RNA引导的核酸内切酶 - 原位标
Nature：蛋白MHC-II介导蝙蝠甲型流感病毒跨物种感染
2019年3月7日讯/生物谷BIOON/---禽源人畜共患病甲型流感病毒（HAV）可在个体中引起严重疾病，甚至全球大流行病，因而对人类构成威胁。水禽和滨鸟被认为是所有HAV的储存库，但是近期在蝙蝠中鉴定新的HAV面临挑战。主要的蝙蝠HAV包膜糖蛋白---血凝素---与常规的血凝素存在着高度的序列同源性和结构同源性，但是并不结合典型的HAV受体，即唾液酸或任何其他的聚糖。蝙蝠HAV血凝素的这种功能上
新研究揭示B1细胞的起源
2019年2月20日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，德国马克斯-德尔布吕克分子医学中心的Klaus Rajewsky教授及其团队报道B1细胞的产生并不需要不同的祖细胞。相反，他们的实验表明B1典型的B细胞受体（B1-typical B-cell receptor）能够将B2细胞重编程为B1细胞，这表明B1细胞是由于它们的特殊B细胞受体而出现的。这项研究可能会解决一项持续了几十年的免疫
北京基因组所开发跨物种长非编码RNA鉴定软件LGC
近日，基因组所在国际生物多样性与健康大数据（Global Biodiversity & Health Big Data，简称BHBD）联盟框架下，与沙特阿卜杜拉国王科技大学、巴基斯坦真纳大学以及美国梅奥医学院开展科研合作，联合开发了可跨物种使用的长非编码RNA（long non-coding RNA， lncRNA）鉴定软件LGC。该成果以“Characterization and ide