三个实例:“基于动力学的数据科学”在生命科学中的应用
21世纪以来,生物大数据在量(多数据种类,海量样本数,多时间点采样等)、质(高时空精度,单细胞测序等)两方面快速发展,大大推动了生命科学的进步,也为生物医学问题的模型建立、数据分析,以及预测和控制,带来了巨大的机遇和挑战。传统的生物学数据研究方法大多基于数据的静态统计信息,即“基于统计学的数据科学”(statistics-based
Sci Trans Med: T细胞及抗体动力学特征反映COVID-19恢复期患者的长期免疫应答
针对SARS-CoV-2的长期免疫记忆的形成对于群体免疫至关重要,这也是疫苗接种的目标所在。然而,目前对于COVID-19患者体内T细胞的长期记忆方面的了解仍不十分清楚。在最近一项研究中,来自德国图宾根大学的Juliane S. Walz团队调查了感染后长达6个月的COVID-19恢复期患者样本中的SARS-CoV-2抗体和T细胞应答情况,相关结果发表在最近
研究人员发表生物质烘焙动力学和热化学研究论文
上海交大农业与生物学院生物质热化学转化工作室在木质生物质烘焙动力学及热化学研究方面取得重要进展,相关研究成果近期发表在Renew. Sust. Energ. Rev.上。该期刊是能源与燃料(Energy & Fuels)领域顶尖期刊,最新影响因子为12.110,主要发表与可再生能源相关的研究论文和综述等。农林生物质具有水分和氧含量高、热值和能量密度低
Mol Cell:报道TFp300共凝聚调控基因转录爆发动力学
p300和它的同源基因CREB-binding protein(CBP)是转录调控过程中发挥重要作用的转录共激活因子【1】。p300/CBP的突变或者染色体易位会引起基因表达紊乱和疾病的发生【2】。前人的研究结果表明,p300/CBP至少通过两种方式来调控基因转录【3】。一方面,p300/CBP可以作为桥梁/支架来调控转录因子(TF)
science:新研究鉴定出了偏头痛关键受体的结构和动力学,为更好的疗法铺平了道路!
2021年3月6日讯/生物谷BIOON/--在一项研究中,来自澳大利亚莫纳什大学、ARC膜蛋白低温电镜中心、日本东京大学和新西兰奥塔哥大学的研究团队鉴定了一种重要的细胞表面(膜)受体的形状和动力学,这种受体叫做降钙素相关基因肽(calcitonin gene-related peptide,CGRP),长期以来一直被认为与偏头痛有关联。相关研究结果已经发表在
研究开发操控人脑工作记忆的“动态扰动”新范式并建立神经网络动力学模型
工作记忆指对外界信息的短暂存储和操作能力,是脑认知核心功能。记住和拨打一个新号码,和朋友聊天,听一场讲座,都需要工作记忆的参与。心理与认知科学学院、麦戈文脑研究所罗欢研究员课题组在以往发现基础上,成功开发出一种全新“动态扰动”行为范式,通过在记忆保持阶段呈现有特定时间关系的多个动态亮度序列对人类序列工作记忆进行操控。课题组进一步和重庆大学弭元元研究员合作,建
Nature:新研究表明揭示癌症细胞中RNA结合蛋白的动力学景观
2021年2月15日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自美国凯斯西储大学的研究人员找到了一种方法来测量细胞中与RNA结合的蛋白的关键特征---这一发现可以提高我们对癌症、神经退行性疾病或感染中基因功能如何被干扰的理解。相关研究结果于2021年2月10日在线发表在Nature期刊上,论文标题为“The kinetic landscape of a
科学家解码不同组织中p53的动力学变化特性 或有望帮助开发新型抗癌疗法!
2021年2月24日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在国际杂志Nature Communications上题为“p53 dynamics vary between tissues and are linked with radiation sensitivity”的研究报告中,来自哈佛医学院等机构的科学家们通过研究表示,揭示肿瘤抑制蛋白的动态学
研究实现活细胞膜蛋白动力学精密测量
细胞膜既是保护细胞的重要屏障,也是细胞与外界物质和信息交换的界面。空间总厚度约为10纳米的细胞膜(含突出于细胞膜两侧的膜蛋白结构)可被视为准二维凝聚相体系。磷脂双层膜及镶嵌于膜上的众多蛋白质,整体上具有“多重界面复杂流体”的行为和特征。膜本身的二维流动性和三维起伏涨落为膜蛋白动力学的精密测量造成干扰。膜蛋白动力学的实时精密测量,是膜生
研究揭示噪声驱动的细胞不同状态间跳转的动力学机理
细胞生活在不断变化的复杂环境中。通过信号转导通路,细胞传递外部信号和刺激到细胞内部的调控网络,产生反应和应激。对于噪声在信号转导过程中的作用和对细胞状态的影响,人们还缺乏直接的实验证据和定量的研究。为了研究噪声在细胞信号转导通路中的作用,北京大学物理学院、前沿交叉学科研究院定量生物学中心李方廷、欧阳颀团队和数学科学学院李铁军课题组以及