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Genome Biology:科研人员开发出在单细胞中识别染色质类染色质拓扑相关结构结构的算法

  基因组DNA和组蛋白以特定的形式高度折叠在细胞核中,这一高级结构即三维基因组学,对细胞核内的诸多生命活动至关重要。基于染色质构象捕获(3C),尤其是高通量技术(Hi-C,ChIA-PET)的发展推动了三维基因组的研究,发现了包括染色质拓扑相关结构域(TAD),染色质环等一系列层次化的结构特征。近年来,单细胞水平下的Hi-C研究成为三维

2021-08-02

Cell 重磅揭示大肠杆菌染色体折叠模式及影响因素

染色体是细胞生命活动的物质结构基础,与多种细胞过程息息相关,如基因表达、DNA 修复和染色体分离,其正确折叠至关重要。所有细胞都须将自身的基因组通过折叠压缩在一个小体积空间当中。与真核细胞不同,细菌细胞没有核膜,并且不会将其染色体 DNA 包装成类似于核小体的重复结构单元。然而,它们仍然折叠并集中它们的染色体物质,形成一个动态的、有组织的 DNA 网络,称为

2021-07-13

Molecular Cancer:CHEK1和CircCHEK1_246aa诱发多发性骨髓瘤染色体不稳定和骨损伤形成

多发性骨髓瘤(MM)仍是一种不治之症,其特征是骨髓浆细胞克隆性增生。因此,有效的治疗干预必须同时针对骨髓瘤细胞和骨髓利基。该研究结果表明,靶向CHEK1mRNA和CircCHEK1_246aa编码的酶催化中心是一种很有前途的靶向MM细胞和BM利基的治疗方法。图片来源:https://doi.org/10.1186/s12943-021-01380-0多发性骨

2021-07-06

PNAS:玉米B染色体基因组图谱和功能研究获进展

  一个多世纪前发现,B染色体在较多植物、动物和真菌基因组中存在。B染色体对于个体的生命活动来说不是必需的,但它们仍通过不同的机制存在于种群中。例如,玉米B染色体不与任何A染色体配对,其传递不遵循孟德尔遗传定律,花粉第二次有丝分裂B染色体会发生不分离(nondisjunction),包含B染色体的精核优先与卵细胞受精,使其能够在群体中传递

2021-06-09

红豆杉染色体水平基因组测序完成

  紫杉醇是目前已发现的最优秀的天然抗癌药物。紫杉醇生物合成途径已研究多年,而超大的基因组和复杂的代谢路线是途径解析的主要限制因素。中国科学院天津工业生物技术研究所与西北工业大学、深圳华大生命科学研究院等合作,首次完成了喜马拉雅红豆杉超10Gb的染色体水平的全基因组测序,并通过复杂基因组组装与分析,解析了红豆杉中生物合成紫杉醇的关键基因簇

2021-06-01

猪胚胎期骨骼肌染色体开放性研究方面取得进展

  近日,猪遗传育种创新团队绘制了涵盖猪胚胎发育全期骨骼肌基因组染色质开放区域精细图谱,鉴定了调节肌肉发育的顺式调控元件及相关基因,为更好地研究猪胚胎骨骼肌发育相关基因的调控动力学奠定了基础。相关研究成果发表在《畜牧与生物技术杂志(Journal of Animal Science and Biotechnology)》上。据团队执行首席

2021-05-24

Cell:揭示受精时父本和母本染色体结合在一起极其容易出现差错

2021年5月21日讯/生物谷BIOON/---三次受精中只有一次能成功怀孕。许多胚胎在早期发育之后无法继续发育。如今,在一项新的研究中,来自德国和英国的研究人员开发出一种新的模型系统来研究早期胚胎发育。在这种系统的帮助下,他们发现当来自父本和母本双方的遗传物质在受精后立即结合时,往往会发生错误。这是由于一个明显低效的过程造成的。相关研究结果近期发表在Cel

2021-05-21

关于相分离通过调控染色质三维结构重组促进细胞命运转变的研究在Cell Stem Cell发表

真核细胞染色体通常会有序的折叠,在空间上会形成有序的三维结构。这些三维结构由大到小主要分为区室分隔(compartments)、拓扑相关结构域(Topological-Associated Domains,TADs)以及染色质环状结构(loops)等。细胞命运转变过程中往往伴随着染色体三维结构的剧烈变化,而这些变化对于推动细胞命运转变的进行起到重要作用。TA

2021-06-03

Nature:完整人类第八号染色体结构,功能和进化研究取得进展

  自20年前人类基因组测序宣布以来,由于着丝粒内聚集了大量高度相同的重复区域、片段重复区域和染色体的近端短臂,人类染色体的研究一直没有完成。大量(超过100kb)高度相同的重复序列是拷贝数多态性的,这意味着这些区域一直作为缺口存在,这限制了我们对人类遗传变异和进化的理解。每个人类染色体的完整组装对于理解人类生物学和进化是必不可少的。美国

2021-04-11

Biosensors and Bioelectronics:发表了基于DNA六面纳米结构实现循环肿瘤DNA同时检测的研究成果

近期,江南大学生物工程学院周楠迪教授团队在利用DNA自组装技术构建肿瘤标志物生物传感器方面取得重要进展,研究成果“An ultrasensitive biosensor for dual-specific DNA based on deposition of polyaniline on a self-assembled multi-functional D

2021-05-15