从单细胞转录组中解析出人类肿瘤中的拷贝数和克隆亚结构
美国德克萨斯大学MD安德森癌症中心Nicholas E. Navin团队开发出新方法,可从单细胞转录组中解析出人类肿瘤中的拷贝数和克隆亚结构。该研究于近日在线发表于国际一流学术期刊《自然—生物技术》。研究人员表示,单细胞转录组学分析被广泛用于研究人类肿瘤。然而,将肿瘤微环境中的正常细胞类型与恶性细胞区分开并解析肿瘤内的克隆亚结构仍然具
纳米孔全长cDNA测序和直接DNA甲基化分析解决大麻基因组拷贝数的争论
大麻(Cannabis sativa)通常分为大麻(Marijuana)和工业大麻(Hemp),通常依据植物产生THC(四氢大麻酚)的含量来区分:大麻的THC含量通常较高(> 10%),工业大麻通常较低(<0.3%),但他们都可以产生高水平的CBD(大麻二酚),工业大麻可用作纤维和燃料且市场增长很快。2015年,索尔克生物研究所(Sa
研究发现沉默转基因的激活不依赖于拷贝数和DNA过甲基化的变化
转基因表达的稳定性在种苗商业化生产中具有重要作用,然而基因沉默现象影响着这种稳定性的产生与维持。中国科学院华南植物园区永祥团队长期致力于多基因定点叠加技术的研发以加快分子育种进程。要获得定点叠加的多基因材料并非易事,在烟草中的实验结果表明,其效率约为5%,可是在这些留下的材料中,却有1/3存在转基因沉默现象,无法正常使用(Hou et al.,
Curr Biol:关键基因拷贝数决定后代性别比例以及雄性精子活性
2019年10月20日 讯 /生物谷BIOON/ --最近,在《Current Biology》杂志上发表的一篇新文章中,密歇根大学医学系的研究人员通过研究小鼠性染色体,发现一些基因的拷贝数会影响后代的性别决定,而且可能会对雄性不育症产生重大影响。 文章作者,Alyssa Kruger博士表示:“此前研究已知存在一些导致男性不育的基因,但仍然有很多是不清楚的。”在首席研究员Jacob M
Vertex复方药Orkambi获欧盟批准,用于2-5岁双拷贝F508del突变儿童
2019年1月23日讯 /生物谷BIOON/ --囊性纤维化(CF)领域的领导者Vertex制药公司近日宣布,欧盟委员会(EC)已批准CF复方药物Orkambi(lumacaftor/ivacaftor)标签扩展,用于年龄在2-5岁、CFTR基因中存在双拷贝F508del突变的儿童患者。此次批准,使Orkambi成为首个也是唯一一个用于2-5岁、双拷贝F508del突变儿科患者的药物。之前,Ork
核糖体RNA基因拷贝数变异和表达调控方面获进展
核糖体是细胞中最重要的细胞器之一,负责将细胞转录出来的信使RNA(messenger RNA,简称“mRNA”)翻译成蛋白质。真核生物的核糖体,主要由4种核糖体 RNA(rRNA)和80多种核糖体蛋白组成。其中,45S rRNA基因位点通过转录加工可以产生18S、5.8S和25S rRNA;而5SrRNA基因位点行使5S rRNA的转录。随后,25S、5.8S以及5S RNA结合核糖体蛋白形成核糖
跳跃基因劫持卵子发生大规模传播自身拷贝
2018年8月13日/生物谷BIOON/---我们的DNA序列中的将近一半是由跳跃基因(也被称为转座子)组成的。它们在发育中的卵细胞的基因组内跳跃,而且在进化中起着重要的作用。但是,它们的移动也会导致新的突变,从而引发血友病和癌症等疾病产生。值得注意的是,人们对它们在发育中的生殖细胞内移动的时间和地点知之甚少。毕竟,这是确保跳跃基因在后代中传播的关键过程,但也可能导致宿主患上遗传疾病。为了解决这个
Nat Commun:量子点标记实现活细胞内单拷贝艾滋病毒基因的原位成像
单拷贝 HIV 整合态前病毒 DNA 原位标记与成像艾滋病毒基因组 RNA 逆转录为 DNA,整合在宿主染色体内形成前病毒(HIV provirus),是根除艾滋病毒的最大障碍。在活细胞内对单拷贝或低拷贝的整合态 HIV 基因标记与成像,对前病毒的识别和切除具有重要意义,但一直是个难题。最近,中国科学院武汉病毒研究所研究员崔宗强与中国科学院生物物理研究所研究员张先恩合作,利用量子点标记转录激活子样
“坏”拷贝基因使人衰老
研究人员已经确定了破坏正常脑衰老并可能增加对阿尔茨海默病和其他神经变性病症的易感性的常见遗传变异体。在一项新的研究中,研究人员发现,具有基因TMEM106B的两个"坏"拷贝基因的老年人在额叶皮层(与更高认
“生物遗传”数据存储技术实现巨大飞跃,指尖大小芯片拷贝440亿份
相比于DNA存储,闪存、硬盘、软盘、光驱、录影带这些存储工具简直弱爆了。当计算机工程师宣称自己取得了惊人突破,可以将所占空间巨大的音乐库和电影库存储在手掌大小的设备中时,生物遗传学家马上泼来一盆冷水:跟