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生物谷专访李孟鸿教授:从肿瘤异质性角度认识癌症

编者按:肿瘤异质性是指同一种恶性肿瘤在不同患者个体间或者同一患者体内不同部位肿瘤细胞间从基因型到表型上存在的差异。这种差异发生在不同个体中可表现出不同的遗传背景如染色体量与质的差异,不同细胞病例类型、不同临床阶段不同分化程度细胞演进的多样性,同质肿瘤在分子水平也存在显著差异:比如基因表达谱、网络调控、突变谱等方面的不同。发生在同一肿瘤患者体内可表现出不同部位肿瘤细胞间的突变基因谱和生物学特性等方面

2017-08-07

昆明动物所开发出适用于高通量异质性数据算法并成功揭示泛肿瘤存在基因表达紊乱共有模式

  挖掘肿瘤大数据有助于识别和总结肿瘤发生、发展过程的分子变化规律。然而,肿瘤组织高度异质性、批次效应等因素是肿瘤数据分析的重要难题,而目前常用的转录组数据分析方法对于肿瘤离群值极度敏感,容易产生假阴性结果。针对此,中国科学院昆明动物研究所科研人员开发了一种新的不依赖均一化、非参的高维大数据分析算法(Cross-Value Association Analysis,CVAA)。

2017-08-09

肿瘤细胞的异质性,你了解多少?

由Bellvitge生物医学研究所(IDIBELL)表观遗传学和癌症生物学计划(PEBC)的主任Manel Esteller博士、ICREA研究员和巴塞罗那大学(UB)的遗传学教授领导的一项新研究发现,大肠肿瘤表现出涉及到该病临床过程的后生异质性。描述这一发现的论文已经发表在《胃肠病学》杂志上。肿瘤异质性是指同一种恶性肿瘤在不同患者个体间或者同一患者体内不同部位肿瘤细胞间从基因型到表型上存在的差异

2017-07-21

系统异质性:一种理解肿瘤异质性的综合方法

D.C. Wang, X. Wang于2016年8月发表在Semin Cell Dev Biol上的文章:Systems heterogeneity: An integrative way to understand cancer heterogeneity首次阐述了系统性异质性这一概念,为人们理解肿瘤异质性的重要性及复杂性提供更多方向。所谓系统性异质性,是指细胞、组织、器官以及个体之间或内部存在

2017-07-17

认识肿瘤异质性,看清庐山真面目

导读:在临床上、在科研的病例随访中,我们常常发现患有同样疾病(如儿童B淋巴细胞白血病/淋巴瘤)的患者有着天壤之别的预后。这都可能是由于肿瘤异质性导致的,认识了肿瘤异质性,我们才能看清肿瘤的真面目。肿瘤的异质性表现在哪几方面呢?▲图片来源:作者   B淋巴细胞白血病/淋巴瘤:细针穿刺图片肿瘤细胞生长的时间异质性某个个体患有的肿瘤中并非所有肿瘤细胞在某个时间点处于同一生长周期,因此

2017-07-19

肿瘤微环境异质性的研究进展

张清媛教授,哈尔滨医科大学附属肿瘤医院副院长、肿瘤内科主任、博士研究生导师,中国临床肿瘤学会(CSCO)常委,中国抗癌协会乳腺癌专业委员会委员,中国抗癌协会淋巴瘤专业委员会委员。在肿瘤发生及发展过程中,肿瘤微环境起着至关重要的作用。肿瘤微环境是由非肿瘤基质细胞构成,包括免疫细胞,成纤维细胞,内皮细胞和新生毛细血管系统等,其通过与肿瘤细胞之间的相互作用来影响肿瘤的发生发展。已有研究发现肿瘤微环境的异

2017-07-14

都是肿瘤异质性惹的祸!

2016年,来自美国希德斯-西奈医疗中心(Cedars Sinai Medical Center)研究人员的一项新研究在食管肿瘤组织样本中鉴定出超过2,000个遗传突变,在阐明了癌症复杂性的同时,他们的研究结果显示甚至是在同一肿瘤组织的不同区域,不同的肿瘤细胞也有着大相径庭的遗传模式。该研究对应的论文发表在最新出版的NatureGenetic上。该研究在一定程度上解释了为什么根据特定遗传缺陷设计的

2017-07-12

Cancer Cell:表观遗传的肿瘤异质性

表观遗传学修饰可以在不改变DNA序列的情况下调控基因的活性,广泛参与了细胞对基因表达的控制,在细胞生长、细胞分化、细胞增殖和疾病状态中起到了关键性的作用,由此不少科学家都展开了表观遗传与癌症发生发展的研究。肿瘤异质性现象很早就被科研人员所关注,最常见的现象比如肿瘤细胞系建立过程中只有一部分细胞能无限繁殖,裸鼠成瘤实验需要上百万细胞等,这些都说明存在肿瘤细胞异质性现象。此前也有研究显示化疗药物和靶向

2017-07-10

梳理肿瘤异质性研究进展

肿瘤异质性是恶性肿瘤的特征之一,是指肿瘤在生长过程中,经过多次分裂增殖,其子细胞呈现出分子生物学或基因方面的改变,从而使肿瘤的生长速度、侵袭能力、对药物的敏感性、预后等各方面产生差异。本文中,小编对近期和肿瘤异质性进展相关的研究报道进行盘点,分享给各位!【1】Nature:乳腺癌异质化很早即出现doi:10.1038/nature15742乳腺癌是一类高度异质性肿瘤,组织学形态和基因组差异都显多样

2017-06-29

浅谈乳腺肿瘤异质性

在过去的二十多年里,很少有疾病像乳腺癌一样获得如此多的研究进展,特别是近年来,单细胞研究技术不断进步,掀起了肿瘤异质性研究的热潮。2012年 Gerlinger的研究有力证实了肿瘤异质性的存在。随后,肿瘤异质性问题越来越多地出现在学术杂志的研究和综述之中。对于临床医生而言,肿瘤异质性对临床工作和转化研究有哪些影响?本文就乳腺癌肿瘤异质性问题进行分享。肿瘤异质性的范围肿瘤异质性可粗略地分为时间异质性

2017-06-12