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国际花生基因组计划首次完成并公布两个二倍体野生种全基因组序列

2014年4月2日,由多国农作物遗传学家参与的国际花生基因组计划(International Peanut Genome Initiative,IPGI)终获喜报。

2014-04-22

Science:不活跃基因在人体DNA序列中普遍存在

近日,英国和美国的研究人员发现健康个体存在许多这样的变异,因基因功能缺失而导致囊肿性纤维症和肌肉萎缩症等疾病。论文的作者表示,这项研究有助于研究人员区分常见无害的遗传变异和罕见危险的遗传变异,从而更好地查明突变导致的疾病。相关论文发表在近期的Science杂志上。

2012-11-18

Science:从宏基因组数据中分离出单个物种基因组序列

从由细菌、古细菌和病毒组装的错综复杂宏基因组DNA序列中,研究人员获得一种神秘的广古菌的整个基因组序列。图片来自Vaughn Iverson/华盛顿大学。 宏基因组学(metagenomics,译者注:也常译作环境基因组学)就是取样---一勺泥土或一杯海水---然后对样品内所有DNA进行测序。

2012-11-18

BBRC:章张团队研究开发出DNA序列并行比对新工具

最近,中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室“百人计划”章张研究员,带领其团队成功开发出“编码蛋白质DNA序列并行比对工具—ParaAT(Parallel Alignment and back-Translation)”。

2012-11-18

BBRC:章张等开发出编码蛋白质DNA序列并行比对工具ParaAT

近日,国际杂志Biochemical and Biophysical Research Communications在线刊登了中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室“百人计划”章张研究员团队的最新研究成果,研究者成功开发出“编码蛋白质DNA序列并行比对工具—ParaAT(Parallel Alignment and back-Translation)”。

2012-11-18

研究揭示了TDP-43蛋白中的淀粉样核心序列是形成积聚和包涵体的原因

7月5日,国际学术期刊《The Journal of Biological Chemistry》发表了生化与细胞所胡红雨课题组的研究论文 “Structural Transformation of the Amyloidogenic Core Region of TDP-43 Protein Initiates Its Aggregation and Cytoplasmic Inclusion”。

2013-07-12

Veter Res:大鲵虹彩病毒的全基因组序列及其结构变化

大鲵 (或称娃娃鱼) 是世界上现存最大的濒危珍稀两栖动物,为我国所特有、被列为国家二级保护野生动物。虹彩病毒在全球范围普遍流行,是侵染众多鱼类、两栖类及爬行类等水生动物的重要病毒病原。有证据表明,虹彩病毒是包括蛙和大鲵在内的两栖类自然种群显著下降或消亡的原因之一,而鉴定虹彩病毒病原并阐明其基因组结构特征是研发相应病害防控技术的前提。

2013-10-24

Nat Rev Gene:占用与序列的复杂性

近日,刊登在国际著名评论杂志Nature Reviews Genetics上的研究指出,基因组非编码区域的变化越来越多地被涉及到复杂性状间的个体差异,包括疾病易感性,然而阐释非编码变化的功能效应却是一项特殊的挑战。最近发表的两篇论文系统地研究了SNP对于转录因子结合的影响,从而表明尽管序列与结合之间的一些趋势正如预期的那样,但预测特定SNP的效应将是很困难的。

2012-05-10

Nature:一种软骨鱼的第一个基因组序列

本期Nature发表了象鲨的基因组序列。

2014-01-13

Nature:一个“尼安德特”女子的基因组序列

最近在南西伯利亚阿尔泰山脉的“丹尼索瓦洞穴”中所做的挖掘工作,产生了大量原始人类化石。

2014-01-07