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Cell:康奈尔大学郭春君团队成功开发针对非模式肠道细菌的基因编辑工具

多组学的研究表明很多肠道微生物的基因与宿主生理功能密切相关,但是由于这些基因大多源于非模式的肠道细菌,例如厚壁菌门梭菌纲,因此揭示这些基因影响宿主的机制目前是一项挑战。与我们所熟知的具有成熟基因编辑方法的模式肠道细菌 (例如大肠杆菌和多形拟杆菌) 不同,这些非模式肠道细菌大多未进行基因组测序,向其中引入含有基因编辑模块的外源DNA的方法以及采用何种合适的基因

2022-01-22

打开肠道微生物组“窗口”:科研人员开发出流程化、更高效的基因编辑工具

  基因,就像是指挥官手里拿着的建筑总图纸,调控着生物体的一切生命活动。这份施工的图纸决定了整个建筑的所有呈现形式。那怎么才能对“图纸”——基因进行编辑呢?CRISPR/Cas编辑系统被认为是最佳的一种工具。中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所、深圳合成生物学创新研究院戴磊课题组在ACS Synthetic Biology上发表最

2022-01-11

Nature:推出一种新的药物发现工具,可以筛选超过110亿个化合物

在一项新的研究中,研究人员验证了V-SYNTHES,这是一种新型的计算方法,由南加州大学的Vsevolod Katritch博士开发,允许科学家们首先确定称为synthon-----分子内的假设单元---的构成单元(building block)的最佳组合。

2021-12-23

Cell Rep:科学家开发出前所未有的工具来可视化分析研究DNA的修复过程

在机器学习应用于高通量显微镜等技术的帮助下,研究人员就能设法详细观察这种DNA修复机器,并能识别出一种新的修复蛋白,相关研究结果以题为“Assessing kinetics and recruitment of DNA repair factors using high content screens”的形式发表在国际杂志Cell Reports上,或有望未来帮助科学家们开发新型癌症疗法。

2021-12-31

Nature:科学家利用分子条形码工具揭示兴奋性和抑制性神经元或许拥有共同的起源祖细胞

2021年12月31日 讯 /生物谷BIOON/ --大脑皮层是一种细胞复杂结构,其包括丰富多样的神经元和胶质细胞类型,皮层神经元(Cortical neurons)大致分为两类,即使用神经递质谷氨酸的兴奋性神经元(excitatory neurons)和使用γ-氨基丁酸(GABA)的抑制中间神经元(inhibitory interneurons),此前对啮

2021-12-31

我国科学家开发高效基因组序列分析工具

 人类的疾病易感性和生理特征等常见性状的差异,往往由DNA序列变化造成,这些DNA片段缺失、增加、异位等变化被统称为遗传变异。全基因组关联研究(Genome-Wide Association Study,GWAS)是通过比对大量人群的遗传信息,利用统计学检测遗传变异和性状之间关联性的方法。西湖大学的研究团队开发了可用于百万级生物样本库的全基因组关联

2021-12-08

Science:使用机械工具可以提高我们的语言技能,反之亦然

2021年11月14日讯/生物谷BIOON/---我们理解复杂句子的句法的能力是最难掌握的语言技能之一。在2019年,已有研究揭示了特别精通工具使用和拥有良好的句法能力之间的相关性。在一项新的研究中,来自法国Inserm、CNRS、里昂大学和瑞典卡罗林斯卡研究所的研究人员发现这两种技能都依赖于位于同一个大脑区域的相同的神经资源。此外,使用工具的运动训练提高了

2021-11-15

Development:滋养层类器官或有望作为研究女性早期怀孕和妊娠并发症的有力工具

来自剑桥大学等机构的科学家们通过研究比较了人类胎盘的两种主要的实验模型,结果发现,名为滋养层类器官(trophoblast organoids)的3D胎盘细胞簇或许最适合用来调查母亲和胎儿之间的相互作用、激素的分泌或病原体是如何感染子宫内的胎儿的,理解诸如上述过程或能帮助揭示女性孕期并发症发生的分子机理。

2021-11-18

Cell及其子刊揭示利用新开发的EcoTyper工具发现癌症亚型

在一项新的研究中,来自美国斯坦福大学干细胞生物学与再生医学研究所的研究人员设计了一种工具来检查细胞如何在身体的各种环境中作出表现和相互作用。他们利用它更好地了解癌症如何产生和如何加以治疗。相关研究结果近期发表在Cell期刊上。

2021-11-09

Cell:新工具Repair-seq可用于改进CRISPR基因编辑

在第一项新的研究中,美国普林斯顿大学研究员Britt Adamson、麻省理工学院生物系教授Jonathan Weissman、之前在Editas Medicine公司工作的Cecilia Cotta-Ramusino及其同事们详细介绍了一种名为Repair-seq的新方法,它详细地揭示了基因组编辑工具如何发挥作用。

2021-10-31