"女娲"基因组计划第2篇：徐涛/何顺民团队发布中国人群可移动元件插入变异图谱
可移动元件（也被称为转座子或转座元件）约占人类基因组的一半。在人类基因组中，Alu、LINE-1（L1）、SINE-VNTR-Alu（SVA）以及HERV-K等是普遍认为仍然活跃的可移动元件家族，它们能够通过转座作用在基因组上形成新的插入，这种现象被称为可移动元件插入（Mobile Element Insertion，MEI）。转座事
我国科学家描绘拟南芥芽再生染色质状态动态图谱
未来作物设计发展迅速，但植物再生效率低逐渐成为该项技术的关键问题。在以往的研究中，植物芽的再生过程经历了转录水平的大规模重塑，然而生长素和细胞分裂素如何在染色质水平依次调控外植体（离体植物组织）体细胞的命运转变仍不清楚。近日，发表在《Developmental Cell》上的一项题为“Dynamic chromatin state profili
Nature：科学家绘制出炎症的行为性免疫图谱
尽管利用单细胞转录组和蛋白质组学技术可以构建健康以及疾病组织的细胞景观图，但现在科学家还不能描述细胞不断改变的生化特性及其下游的动态情况。近日，西班牙国立心血管疾病研究中心在《Nature》发表了题为“Behavioural immune landscapes of inflammation”的文章。研究人员使用4D活体成像记录了几十
Nat Commun：科学家成功绘制出新型结肠基因图谱 或有望帮助阐明多种肠道疾病发生的分子机制
来自瑞典卡罗琳学院等机构的科学家们通过利用空间转录组学技术分析了小鼠结肠中的基因表达，从而创建了一种能展示单个基因在组织中表达位置的图谱，当研究人员将此前已知的人类转录数据叠加到该图谱上时，研究人员就获得了对炎性肠病的新认识。
开发“细胞命运”预测器
如果我们能“定制”细胞，会发生什么？当人体需要某类细胞时，比如心脏出现问题，就取些成纤维细胞，“定制”打造成心肌细胞来帮助心脏恢复；当人体不需要某类细胞时，比如发生癌变，就引导癌变细胞快速凋亡。几位华人博士为这一设想的实现提供了新的工具。他们开发了一个细胞命运预测模型，能够预测细胞发育所要经历的过程和最终命运。还能给出相应的发育方程，定量描述细胞命运的转变路
Cell Stem Cell：科学家揭示微生物群对造血干细胞命运与功能的调控机制
宿主微生物群对于血细胞谱系的产生和功能调节至关重要。微生物群是否以及如何影响造血干细胞尚不清楚。美国阿尔伯特爱因斯坦医学院的研究团队发现，微生物群通过调节骨髓中的局部铁元素可用性来调节造血干细胞在应激条件下的自我更新和分化。该研究于近日发表在《Cell Stem Cell》上，题为：The microbiota regulates h
Science：通过数学建模揭示细胞如何选择自身命运
在一项新的研究中，来自美国加州理工学院的研究人员根据类似的原则设计出一种称为MultiFate的最小回路架构，在这种架构中，一组转录因子竞争性地形成同源二聚体和异源二聚体，只有同源二聚体才能激活它们自身基因的表达。
“复旦肿瘤”科学家绘制出最大三阴性乳腺癌代谢物图谱
三阴性乳腺癌是“粉红杀手”乳腺癌的一种亚型，约占所有乳腺癌人群的15%。因恶性程度高、复发转移风险大、缺少精准治疗靶点，三阴性乳腺癌又被称为“最凶”乳腺癌。复旦大学附属肿瘤医院乳腺外科邵志敏教授、江一舟教授领衔团队成功绘制出当前世界上最大规模的三阴性乳腺癌代谢物图谱，优化了既往分型标准，为三阴性乳腺癌的精准个体化治疗提供新方向；作为三阴性乳腺癌“复旦分型”研
Human Genetics：基于机器学习建立人类遗传重组图谱取得进展
中国科学院上海营养与健康研究所李海鹏研究组等在Human Genetics上，在线发表了题为Fine human genetic map based on UK10K data set的研究论文。遗传重组是生命进化的基础，在有性生物形成配子的过程中，来自父方和母方的染色体相互交换遗传物质，从而增加了相邻基因间不同等位基因的组合，丰富了
Science：构建出血液蛋白形态图谱，鉴定出有潜力预测肝脏移植排斥的生物标志物
在一项新的研究中，来自美国西北大学等研究机构的研究人员发现体内的蛋白家族有可能预测哪些患者有可能会排斥新移植的器官，从而帮助患者做出治疗决定。这一进展标志着对特定细胞中的蛋白进行更精确研究的新时代的开始。