Nat Biotechnol：中外科学家联手开发出MEMOTE工具，可用于改善对全基因组范围代谢模型的质量控制
2020年3月8日讯/生物谷BIOON/---全基因组范围代谢模型（genome-scale metabolic model, GEM）的应用领域非常广泛，从设计细胞工厂和研究癌症代谢到分析微生物如何在我们的肠道内相互作用。因此，手动和自动生成的全基因组范围代谢模型的出版物数量每年都在增长。这可以被看作是一件积极的事情，但是很多数据对于其他人来说很难在不同的
iScience：果蝇模型帮助揭示病原体感染机制
艰难梭菌是已知会引起腹泻等肠道紊乱的病原菌。在西方国家，梭状芽胞杆菌感染病例的流行已逐渐严重，仅在美国，每年报告的死亡人数就达到了29,000例。
Nat Commun：干细胞、CRISPR以及基因测序共同帮助建立脑癌模型
近日，加利福尼亚大学圣地亚哥分校医学院的研究人员使用基因工程化的人类多能干细胞，创建了一种新型的癌症模型，用于体内研究胶质母细胞瘤如何随时间发展和变化。
Neuroimage：大脑模型揭示中风与损伤背后的机制
布法罗大学的一名神经影像研究人员开发了一种人类大脑的计算机模型，该模型比现有方法更真实地模拟了实际的大脑损伤模式。这项进步代表了两种建立数字模拟环境的方法的结合，该数字模拟环境可以作为特定神经损伤假设的试验场，从而帮助中风受害者和其他脑损伤患者。
J Theor Biol：一种新型模型或能帮助揭示机体免疫系统为何有时会帮助癌症扩散
2020年1月10日 讯 /生物谷BIOON/ --近日，一项刊登在国际杂志Journal of Theoretical Biology上的研究报告中，来自阿尔伯塔大学的科学家们通过研究开发出了一种新型模型，其或能帮助解释机体免疫系统如何与癌症相互作用，这在某些情况下或能帮助癌症扩散到机体其它部位。图片来源：CC0 Public Domain研究者Thoma
SIV感染北平顶猴艾滋病模型的病毒-免疫特征及病程进展方面取得进展
平顶猴是旧大陆猴中唯一可感染HIV-1的非人灵长类动物。平顶猴分为南平顶猴、北平顶猴及明达威猴3个物种，中国分布的平顶猴为北平顶猴。国际上以往研究所用平顶猴均为南平顶猴，鲜见北平顶猴和明达威猴的基础生物学及疾病动物模型研究报道。中国科学院昆明动物研究所郑永唐课题组前期阐明了平顶猴易感HIV的分子机制（Liao et al， AIDS， 2007；
利用机器学习模型探索中药的归经理论
芬兰赫尔辛基大学医学院汤靖教授和他的团队提出了一个机器学习模型来预测中药的归经。该方法将有助于理解中药归经的理论基础。该项目由赫尔辛基大学汤靖教授的网络药理学课题组和华东理工大学唐赟教授的新药设计重点实验室共同合作完成。该结果发表在最新一期的PLOS Computational Biology杂志上。什么是中医？中医已经在千年临床中广泛用于疾病的预防和治疗。
高精度全脑血管图谱揭示阿尔茨海默症模型小鼠脑内血管损伤
阿尔茨海默症（Alzheimer’s disease，AD）是一种严重的中枢神经系统退行性疾病，临床上缺乏能够有效延缓或逆转疾病进程的药物及干预手段，严重危害老年人的身体健康和生活质量，给家庭和社会带来巨大负担。AD的发病机制一直存在胆碱能缺损、β-淀粉样蛋白级联反应、Tau蛋白过度磷酸化等多种假说，然而针对这些假说研发的单一作用机制的药物尚未取得理想的临床
Nat Med：肝脏3D模型有助于诊断肝病
非酒精性脂肪肝病正成为发达国家中最常见的慢性肝病。组织学分析是诊断和区分疾病不同阶段的唯一被广泛接受的测试。但是，该技术仅以提供肝脏组织的低分辨率二维图像，而忽略了潜在的重要3D结构变化。对此，来自德国的Max Planck分子细胞生物学和遗传学研究所的研究人员为不同疾病阶段的人体肝脏组织建立了3D几何功能模型。它们揭示了新的关键组织改变，提供了对病理生理学的新见解，并为高清医学诊断做出了贡献。
EbioMedicine：科学家开发出新型计算模型 有望向癌症个体化疗法迈进一步
2019年12月8日 讯 /生物谷BIOON/ --近日，一项刊登在国际杂志EbioMedicine上的研究报告中，来自赫尔辛基大学等机构的科学家们通过研究开发了一种新型计算模型—结合重要性评分(CES，Combined Essentiality Scoring)模型，其能准确识别出癌细胞中必要的基因，从而帮助开发新型抗癌药物。图片来源：University