Nature子刊:百图生科宋乐团队开发新型蛋白质结构预测工具,不依赖多序列对比,效率更高
与基于MSA的的主流蛋白质结构预测工具AlphaFold2和RoseTTAFold方法相比,HelixFold-Single在预测效率上具有很大优势,耗时要少得多,可以应用于需要大量预测的蛋白质相关任
研究发现MAGI家族蛋白的PDZ-GK超结构域是一种新型磷酸化蛋白识别模块
蛋白质的磷酸化/去磷酸化及其介导的蛋白复合物的组装/解离是细胞内信号转导的关键调控方式之一。磷酸化依赖的蛋白-蛋白相互作用通常是由磷酸化蛋白结合结构域介导。这些结构域包括14-3-3、FHA、MH2、
Science子刊:朱轩/陈福和团队揭示TMPRSS家族以外的膜蛋白酶对于SARS-CoV-2入侵细胞的促进作用及其作用机制
在体外和动物模型中,该研究均证实了相对于SARS-CoV-2原始株而言,Omicron 在入侵细胞的过程中,对于TMPRSS2的依赖性减弱,而对于MT-MMP 的依赖性增强。
Mol Cell:陈勇团队等揭示MLL家族蛋白具有不同产物特异性的分子机制
赖氨酸甲基转移酶催化底物发生甲基化是一类经典的多步催化反应,赖氨酸可以被加上一个、两个、或三个甲基。同一位点不同程度的甲基化状态一般被视为不同的化学修饰标记,发挥着不同的生物学功能。
Science:揭示小分子抑制剂与三磷酸腺苷结合盒式转运蛋白超家族MsbA蛋白变构机制
三磷酸腺苷结合盒式(ATP Binding Cassette, ABC)转运蛋白是一类跨生物膜运输的蛋白。ABC转运蛋白可利用ATP水解释放的能量将细菌胞内有毒化合物排出,从而使细菌产生耐药性。ABC转运蛋白是潜在的小分子药物靶标,但是小分子药物调控ABC转运蛋白的机制仍然不清楚。近日,来自哈佛大学医学院团队在《Science》期刊上发表题为“distinc
Science:人类免疫系统用来促进细胞焦亡的gasdermin蛋白家族竟起源于细菌
在一项新的研究中,来自美国丹娜法伯癌症研究院和以色列魏茨曼科学研究所的研究人员发现人类的免疫系统具有惊人的复杂性、微妙性和精密性,它包括一个有10亿年历史的细菌用来保护自己免受病毒侵袭的蛋白家族。相关研究结果发表在2022年1月14日的Science期刊上,论文标题为“Bacterial gasdermins
Cell Research:揭示SPFH蛋白质家族组织功能性的细胞膜微域的分子基础
北京大学生命科学学院高宁教授课题组在Cell Research上发表了题为“Structural insights into the membrane microdomain organization by SPFH family proteins” 的研究论文,利用冷冻电镜技术研究了位于细菌内膜的由两种具有代表性的SPFH家族蛋白质
全新抗菌蛋白首次揭示!胡泽汗等 Science 发文,告诉你肠道为了抗菌到底有多努力……
哺乳动物的肠道存在一个复杂的微生物群落,包含细菌、真菌、病毒和寄生虫等。虽然说该群落主要由对消化至关重要的共生细菌组成,但也包括机会致病菌和明显的致病细菌和真菌,这些微生物的存在对机体带来了多方面的免疫挑战,例如,蠕虫可引起肠上皮损伤,并引起肠道细菌对组织的侵袭。为了应对这些不同的微生物挑战,肠上皮细胞会产生多种抗菌蛋白(AMPs),这些抗菌蛋白
Science:利用蛋白系统的多尺度图谱解释癌症突变
2021年10月1日讯/生物谷BIOON/---肿瘤基因组测序显示,除了少数常见的突变基因外,影响癌症基因组的大多数突变是罕见的。为了解释这些罕见的事件,一种强有力的方法是根据突变对常见的失去调节的细胞系统的影响来梳理突变。以这种方式理解癌症基因组需要克服两个挑战:(i)如何全面地绘制癌细胞系统?(ii)如何确定哪些系统处于突变选择之下?为了解决这些问题,来