华人科学家最新两篇Nature Biotechnology构建出超精准的碱基编辑器
2020年2月12日讯/生物谷BIOON/---基于CRISPR的基因编辑具有潜在的治疗优势，但也存在一些技术缺陷。在这些基因编辑工具中，碱基编辑器可以重写组成DNA的四个碱基：腺嘌呤（A）、胞嘧啶（C）、胸腺嘧啶（T）和鸟嘌呤（G）。如今，在两项新的研究中，来自美国布罗德研究所和霍华德休斯医学研究所的研究人员发明了新的CRISPR工具，这些工具通过改进碱基
研究揭示RNA poly(A)尾巴内部广泛存在其他碱基修饰
RNA poly(A)尾巴是成熟的mRNA和lncRNA的重要组成部分，对RNA稳定性和翻译起着重要的调控作用。然而目前的poly(A)尾巴检测技术仍然非常有限。11月22日，中国科学院遗传与发育生物学研究所陆发隆研究组在《自然-通讯》（Nature Communications）发表题为Poly(A) inclusive RNA isoform sequencing (PAIso-seq) re
研究揭示碱基编辑器的效能差异并构建可编辑致病突变数据库
近日，中国科学院上海营养与健康研究所杨力研究组与上海科技大学生命科学与技术学院陈佳研究组通过合作，系统揭示了一系列具有代表性的基因组碱基编辑器（baseeditor）的效能差异，并进一步构建了可利用20种已报道碱基编辑器进行编辑的人类疾病相关单碱基突变位点的数据库（BEable-GPS， Base Editable prediction of Global Pathogenic SNVs），相关成
科研人员研发RNA甲基化7-甲基鸟嘌呤测序技术
7-甲基鸟嘌呤（m7G）修饰是转录后调控中最常见的碱基修饰形式之一，广泛分布于tRNA、rRNA以及真核生物mRNA的5’帽子区，对维持RNA的加工代谢、稳定、出核以及蛋白质翻译具有重要作用。近期研究表明高等真核生物mRNA内部也含有m7G修饰，然而对其分布特征和调控作用目前尚不清楚。中国科学院北京基因组研究所杨运桂团队开发了单碱基分辨率的m7G高通量测序技术(m7G miCLIP-seq)，通过
Nat Biotechnol：构建出具有自我编辑活性的DNA碱基编辑器
2019年9月21日讯/生物谷BIOON/---2016年，Komor等人利用16个碱基长的XTEN接头（XTEN linker）将大鼠胞苷脱氨酶APOBEC1与dCas9连接在一起，从而构建出第一代碱基编辑器（BE1）。BE1表现出大约5个核苷酸的活性窗口（activity window）：靶位点4～8。为了增加体内编辑效率，第二代碱基编辑器（BE2）系统除了将胞苷脱氨酶与dCas9连接在一起之
不只有A的poly(A)尾：A碱基纯度影响蛋白质翻译效率
poly(A)尾是真核生物mRNA最重要的特征之一，通常被认为由腺苷酸（A）的简单重复组成。近日，中国科学院遗传与发育生物学研究所、植物研究所与美国宾夕法尼亚大学开展合作，利用新型poly(A)尾高通量测序技术，揭示了拟南芥poly(A)尾介导的全新转录后调控机制——在poly(A)尾中散在分布的鸟苷酸（G）可通过抑制与poly(A)结合蛋白（PAB）的相互作用降低mRNA的翻译效率。该研究发表在
单碱基基因编辑研究进展速览
本文中，小编整理了近年来科学家们在单碱基基因编辑研究领域取得的新进展，分享给大家！图片来源：theconversation.com【1】Nat Commun：科学家首次在猪身上实现多位点单碱基编辑doi：10.1038/s41467-019-10421-8近日，中国科学院广州生物医药与健康研究院赖良学课题组利用单碱基编辑器首次在猪上实现多位点单碱基编辑。据悉，该成果的应用将加速生物医药相关的大动物
Nat Biotechnol：开发出靶向能力和编辑效率得到改善的碱基编辑器
2019年7月28日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，来自美国布罗德研究所、哈佛大学和波士顿儿童医院的研究人员利用一种称为“噬菌体辅助的碱基编辑器连续进化（phage assisted continuous evolution of base editors, BE-PACE）”的系统开发出一种改进碱基编辑器的编辑效率的新方法。相关研究结果于2019年7月22日在线在Nature Bi
Nat Biotechnol：新研究拓宽碱基编辑器的靶向范围
2019年7月22日讯/生物谷BIOON/---基因组编辑技术CRISPR/Cas9被《科学》杂志列为2013年年度十大科技进展之一，受到人们的高度重视。CRISPR是规律间隔性成簇短回文重复序列的简称，Cas是CRISPR相关蛋白的简称。CRISPR/Cas9是由一种原始的细菌免疫系统改编而成的，它的作用方式是首先在基因组的一个靶位点上切割双链DNA。图片来自Nature Biotechnolo
中科院广州生物院首次在猪上实现多位点单碱基编辑
7月3日，记者从中国科学院广州生物医药与健康研究院获悉，该院研究员赖良学课题组利用单碱基编辑器首次在猪上实现多位点单碱基编辑。据悉，该成果的应用将加速生物医药相关的大动物猪模型培育和农业精准育种。相关研究6月28日发表在《自然-通讯》。赖良学表示，该研究首次从细胞、胚胎及动物三个层面探讨了单碱基编辑器对猪多基因进行同时点突变的可行性，并且通过体细胞核移植和胚胎注射两种途径获得两种单位点