《Nature》报道T细胞功能调控的关键转录因子
T细胞是适应性免疫系统的主要组成部分， 它们在病菌感染中被功能活化， 参与宿主防御， 但是遇到自身抗原或者在慢性感染和肿瘤微环境中， 它们会发生命运改变， 进入功能失能命运， 但是调控T细胞功能失能的分子机制会不清楚。本研究通过转录组及表观组学手段，发现功能缺陷的T细胞 [Dysfunctional T cell]， 包括免疫耐受T细胞 [Tolerant T cell] 和慢性感染和肿瘤微环境导
研究揭示干细胞分化关键转录因子
近期，国际学术期刊《细胞-干细胞》（Cell Stem Cell）在线发表了由中国科学院数学与系统科学研究院和美国斯坦福大学科研人员合作的干细胞分化的基因调控网络建模成果。这一成果提出了利用匹配的基因表达和染色质可及性数据刻画转录因子和调控元件结合调控下游基因表达的数学模型，构建了描绘细胞状态转化的染色质调控网络，通过网络分析鉴定出TFAP2C和p63分别为表面外胚层起始和角质形成细胞成熟的关键因
效应性Treg细胞分化的转录调控研究中取得进展
调节性T细胞(Treg)是具有免疫抑制功能的T细胞，其主要的功能是抑制效应T细胞介导的免疫反应及维持机体的免疫耐受。效应性Treg只占次级淋巴器官和外周循环Treg细胞的较少一部分，大多数分布于各种组织脏器，效应性Treg是一群已经接受过抗原刺激、活化程度比较高且具有较强的免疫抑制功能的Treg细胞，这群细胞能够快速迁移进入发生免疫反应的部位，发挥免疫抑制的功能，防止T细胞介导的免疫反
Nat Commun：揭秘转录因子“勘察”细胞基因组的分子机制
2019年2月12日 讯 /生物谷BIOON/ --转录因子（TFs）是一种能调节基因表达的特殊蛋白，其能在完整的基因组中搜索并结合特殊区域来调节基因的表达；我们都知道，转录因子不仅能结合特殊的DNA序列，还能非特异性结合任何DNA链。这些非特异性的关联就能够明显增加转录因子寻找特殊靶点的能力，然而目前研究人员并不清楚在扫描大量基因组、定位以及结合特殊位点时，人类机体中超过1500种转录因子的的效
Nature：利用单细胞谱系图谱追踪细胞直接重编程
2018年12月13日/生物谷BIOON/---直接细胞谱系重编程涉及细胞身份转换，比如Fábio F. Rosa等人近期发现让小鼠成纤维细胞表达三种转录因子PU.1、IRF8和BATF3就可直接将它们重编程为呈递抗原的树突细胞，此外，让人类成纤维细胞表达这三种转录因子也可实现这一点（Science Immunology, 07 Dec 2018, doi:10.1126/sciimmunol.a
Science：我国科学家通过优化单细胞多组学测序技术分析结直肠癌异质性
2018年12月3日/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，来自中国北京大学第三医院、北京未来基因诊断高精尖创新中心和北大-清华生命科学联合中心和的研究人员发现利用优化的单细胞多组学测序能够更好地揭示结直肠癌异质性。相关研究结果发表在2018年11月30日的Science期刊上，论文标题为“Single-cell multiomics sequencing and analyses of hu
研究发现转录因子KLF5参与小鼠乳腺干细胞维持及乳腺发育
乳腺癌是女性中发病率最高的癌症。全球乳腺癌发病率自20世纪70年代末开始一直呈上升趋势。美国8名妇女一生中就会有1人患乳腺癌。中国不是乳腺癌的高发国家，但不宜乐观，近年我国乳腺癌发病率的增长速度却高出高发国家1～2个百分点。据国家癌症中心和卫生部疾病预防控制局2012年公布的2009年乳腺癌发病数据显示：全国肿瘤登记地区乳腺癌发病率位居女性恶性肿瘤的第1位，女性乳腺癌发病率（粗率）全国
Nat Commun：在抗逆转录病毒治疗期间，大多数HIV病毒的持续存在是由于受感染细胞的增殖
2018年11月25日/生物谷BIOON/---根据一项新的研究，即时在接受抑制性的抗逆转录病毒药物（ART）治疗期间，大多数受到HIV感染的细胞仍然存在于HIV感染者体内，这些受感染细胞来自细胞增殖，而不是病毒复制。相关研究结果于2018年11月16日发表在Nature Communications期刊上，论文标题为“A majority of HIV persistence during an
Science：利用单细胞分析揭示蝾螈再生肢体机制
2018年10月30日/生物谷BIOON/---美西螈（Ambystoma mexicanum, 也称钝口螈，六角恐龙）和其他的蝾螈是唯一能够再生全肢的四足动物。在这个复杂的过程中，基因表达的变化调节着新的附属肢体长出，但是人们对损伤如何诱导肢体细胞形成能够分化为多种细胞类型的再生性祖细胞知之甚少。在肢体再生过程中，对单个细胞进行追踪和分子分析将会鉴定出不同的分化途径，并为细胞如何从成熟的静息状态
循环肿瘤细胞捕获及单细胞分析样机在大连研制成功
由大连医科大学牵头，与中国科学院深圳先进技术研究院等多家单位合作，在国家科技计划支持下，历经三年研发，成功构建了具有自主知识产权的循环肿瘤细胞（circulating tumor cell，CTC）捕获及单细胞分析样机，显示出较好的应用前景。CTC是存在于患者外周血中的各类肿瘤细胞的统称，对其进行捕获及分选有助于肿瘤转移风险的预测和判断，可提供治疗反应及预后等重