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Nature Biotechnology :提出单细胞多组数据整合与调控推断新方法

基因的转录在生物学中心法则中处于承上启下的重要环节,与相对“静态”的基因组相比,转录组在不同组织/器官/发育阶段均有显著变化,是细胞完成相应生理/病理功能的重要生物学基础。

2022-05-20

Cell Reports小鼠胚胎早期内耳神经节单细胞转录及其发育轨迹特征分析研究获进展

Cell Reports在线发表了题为Single-cell transcriptomic landscapes of the otic neuronal lineage at multiple early embryonic ages的研究论文,该研究由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心(神经科学研究所)、神经科学国家重点实验室、上海脑科学与类脑研究中

2022-03-28

Nature Biotechnology:科学家验证人类干细胞分化得到的胰岛细胞的功能、代谢及转录情况

移植来自人类多能干细胞的胰岛细胞是一种潜在的糖尿病治疗方法。现阶段尽管在诱导干细胞分化的胰岛细胞(SC-islets)取得了进展,但对其功能特性尚未进行深入研究。芬兰赫尔辛基大学研究团队对干细胞分化得到的胰岛细胞从功能、代谢和转录情况等多个方面进行了全面评估。该研究成果于近日发表在《Nature Biotechnology》上,题为:Functional,

2022-03-21

Nature Immunology: 转录因子家族对静息和活化T细胞表观基因的分级调控

T细胞激活是适应性免疫反应中的一个关键早期事件,受到精细的转录调控

2022-01-22

中山大学生命科学学院RNA团队开发PolⅢ转录的非编码RNA功能网络信息库

中山大学生命科学学院RNA组学团队杨建华教授等开发了Pol3Base数据和信息库,系统鉴定RNA聚合酶III(PolⅢ)转录的非编码RNA(P3RNA),全面解析P3RNA的互作组、表达、进化、表观转录组、疾病变异及调控网络。Pol3Base 网站整合了由不同转录因子调控的数千个 RNA 聚合酶 III 转录的 ncRNAs 转录组数据。Pol3Base 的

2022-01-02

直播来袭 | 单细胞功能蛋白质在肿瘤研究及治疗中的应用

IsoPlexis致力于提供业内广受赞誉的精准单细胞分析系统,助力加速对抗癌症及各种疑难病症的进程。通过揭示细胞亚群中独特的免疫生物标志物,推动免疫疗法及靶向治疗迈向更精准、个性化的发展阶段。

2021-12-15

单细胞转录揭示了Shp2在myc驱动的肝肿瘤细胞和微环境中的相反作用

myc驱动的肝脏肿瘤发生机制尚不清楚。该研究表明,在肝细胞特异性Ptpn11/ Shp2缺失的小鼠中,Mycdriven肝癌(HCC)显著加重。

2021-11-30

单细胞转录研究难治性多发性骨髓瘤亚克隆特异性微环境影响和药物反应

随着时间的推移,几乎所有的多发性骨髓瘤患者对治疗都会变得毫无反应。复发性/难治性多发性骨髓瘤(RRMM)伴随着骨髓瘤细胞的克隆性进化,并伴有异质性基因组畸变和骨髓微环境的深刻改变。然而,导致耐药性的分子机制仍然难以捉摸。

2021-12-09

Nat Biotechnol:利用个性化磷蛋白揭示人体肌肉细胞中的哪些蛋白对增加运动后的糖吸收最为关键

在一项新的研究中,来自澳大利亚悉尼大学和丹麦哥本哈根大学的研究人员开发出一种新的方法来确定我们细胞中的哪些蛋白对增加运动后的糖吸收最为关键---这是运动的一个重要好处,可以帮助维持良好的血糖水平。

2021-12-19

Cell:新研究构建出人类基因中的单细胞染色质图谱

在一项新的研究中,来自美国加州大学圣地亚哥分校的研究人员为人类基因组构建出单细胞染色质图谱。染色质是真核细胞中发现的由DNA和蛋白组成的复合物;在某些细胞核内,关键基因调控元件所在的染色质区域以开放的结构出现。在不同人类组织类型的细胞中精确地确定这些可访问的染色质区域将是理解基因调控元件(非编码DNA)在人类健康或疾病中的作用的重要一步。

2021-11-22