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研究建立首个人类肢体发育的单细胞时空图谱并解析关键调控机制

发育过程中,我们四肢的形成并非一蹴而就,而是经历过复杂的细胞演变过程。在胚胎发育第四周末,四肢仅以简单的几乎均一细胞团形状凸起出现在身体的两侧,但到了第八周,这一细胞团则已经完全分化,形成具有复杂解剖

2023-12-16

科研人员发表关于单细胞和空间学技术在肝脏领域应用的综述文章

该文章介绍了多种前沿单细胞组学实验技术和空间组学实验技术并总结了常见的应用场景,剖析了这些新兴技术应用于肝脏样本可能产生的问题及潜在的实验或计算生物学解决方案。

2023-07-20

Sci Transl Med:科学家绘制出人类足月分娩期间机体胎盘组织的单细胞图谱

研究人员通过利用单细胞RNA测序(也称为单细胞转录组学)创建了胎盘图谱,该图谱能分析单一细胞的活性和型号模式。

2024-01-23

Cancer Cell:李博等开发机器学习算法,首次在单细胞水平追踪癌细胞和T细胞间线粒体传输

该研究不仅证实了T细胞与癌细胞间线粒体传输在不同癌症中的广泛存在, 更重要的是,提出了基于贝叶斯层次模型与统计反褶积的机器学习方法——MERCI,实现了在单细胞分辨率下追踪不同细胞间线粒体传输的重要功

2023-10-13

Nature:利用新开发的Slide-tags技术在单细胞分辨率上构建组织内细胞遗传活动的空间模式图谱

当科学家们想要在分子水平上研究心脏或大脑等器官内的单个细胞时,他们通常会将组织打碎来分析细胞。这提供了有关基因活性的丰富细节,但无法保留细胞在组织中的位置信息。

2023-12-26

Cell:利用新开发的CellHint将来自世界各地的单细胞数据统一起来

在一项新的研究中,来自英国韦尔科姆基金会桑格研究所、剑桥大学、EMBL 欧洲生物信息研究所(EMBL-EBI)等研究机构的研究人员开发了一款名为 CellHint 的工具,用于人类健康和疾病研究。

2024-01-22

科研人员建立单细胞轨迹推断技术

总之,PhyloVelo是利用单细胞谱系和转录组数据重建细胞命运转变的新方法,具有高度的准确性和鲁棒性。PhyloVelo可以克服传统RNA velocity方法的局限性,并可以发现隐藏在转录组数据中

2023-08-03

研究人员开发基于单分子测序平台的单细胞多组学测序技术

单细胞多组学测序技术是指对一个单细胞同时检测多个组学层面(例如基因组、表观基因组和转录组)的测序技术。这类技术可以更系统、全面地探索细胞异质性以及同一个细胞内的不同组学层面之间的互动关系,有利于更深入

2023-10-03

单细胞多组学技术揭示三维基因与基因表达的关系

在高等真核生物中,基因组在细胞核内的三维空间构象对细胞功能至关重要。例如,增强子常常通过三维空间相互作用对远端目的基因的转录活性起调控作用

2023-06-21

J Dent Res:新研究成功绘制牙髓干细胞和牙周膜干细胞的基因图谱

在一项新的研究中,来自美国牙医协会福赛斯研究所(ADA Forsyth Institute)和北卡罗来纳大学教堂山分校的研究人员利用单细胞转录组分析,成功绘制了牙髓干细胞(dental pulp st

2024-01-17