从单细胞转录组中解析出人类肿瘤中的拷贝数和克隆亚结构
美国德克萨斯大学MD安德森癌症中心Nicholas E. Navin团队开发出新方法，可从单细胞转录组中解析出人类肿瘤中的拷贝数和克隆亚结构。该研究于近日在线发表于国际一流学术期刊《自然—生物技术》。研究人员表示，单细胞转录组学分析被广泛用于研究人类肿瘤。然而，将肿瘤微环境中的正常细胞类型与恶性细胞区分开并解析肿瘤内的克隆亚结构仍然具
基于CRISPR/Cas9的单细胞谱系追踪，揭示癌症异种移植物转移的速率、途径和驱动因子
2021年1月25日讯/生物谷BIOON/---当癌症局限于身体的一个部位时，医生通常可以通过手术或其他疗法进行治疗。然而，大部分与癌症有关的死亡，是由于它的转移倾向，发送自己的种子，可能在全身生根。转移的确切时刻转瞬即逝，迷失在肿瘤中发生的数百万次分裂中。美国怀特黑德研究所成员Jonathan Weissman说，“这些事件通常是不可能实时监测的。”如今，
研究构建一个单细胞取样及小RNA检测的集成式单细胞电化学检测器件
细胞是生命结构和功能的基本单位，基于细胞的研究是生命研究的基础。为了揭示生命活动的规律，人们在不断的探索细胞的生长与分化、代谢与繁殖、运动与通讯、衰老与凋亡、遗传与进化等生命过程中的化学本质和规律。但是，由于细胞自身特性和研究手段的限制，当下生命科学研究通常以大量细胞为研究样本，然而基于大量细胞的实验结果难以反映单细胞水平上的生命活动
中山眼科中心肖传乐和刘奕志团队开发Nanopore测序数据新校正组装算法，并组装视网膜母细胞瘤的高完整度基因组
三代测序技术（PacBio和Oxford Nanopore）可解决基因组重复区域的组装难题，提高基因组完整性，已成为发育、再生、肿瘤和其它疾病过程中细胞基因组组装的主流技术。其中，纳米孔（Nanopore）测序技术的迅速发展更使得测序成本显着降低，并且由于其可实现超长读长（高达1Mbp），在复杂基因组组装中具有天然优势。然
步辐射单细胞红外显微成像研究获进展
单细胞技术因有望揭示“细胞功能异质性机制”这一生命科学的本质问题，从而解析各种慢性疾病（如癌症、糖尿病和神经退行性疾病）和衰老的分子基础，是当前生物医学的研究热点和重点方向。单细胞技术在测序方面取得了进展；由于该技术具有无须标记、非侵入性、可同时展示胞内代谢物（组）特征等优点，逐渐得到学界关注。近期，中国科学院上海高等研究院研究员吕军鸿课题组先后
Cell：对埃博拉病毒进行单细胞研究，揭示了这种病毒的致命策略
2020年11月15日讯/生物谷BIOON/---埃博拉病毒是世界上最致命的病原体之一。如今，在一项新的研究中，来自美国国家卫生研究院（NIH）、布罗德研究所、麻省理工学院和斯坦福大学等研究机构的研究人员报告了埃博拉病毒在感染过程中如何改变宿主免疫反应以有利于自己的新细节。他们鉴定出这种病毒抑制的抗病毒防御基因，以及这种病毒激活的其他基因，以便潜在地促进它在
研究开发出基于深度学习的单细胞转录组分析模型
单细胞转录组作为单个细胞的特征，可更加精确地定义细胞的类型。常规的基于单细胞转录组的分类方法首先是进行无监督的聚类，然后根据每个集群（Cluster）特异表达的细胞标记基因来对集群进行标注。虽然基于无监督的分类方法更容易发现新细胞类型，但是人工标注的过程费时费力。目前已有的基于监督学习的自动分类方法，大部分无法兼顾到方法的可解释性以及
Immunity：新技术可帮助修复单细胞RNA测序的丢失数据
从单个细胞中测序RNA可以揭示有关这些细胞在体内做什么的大量信息。麻省理工学院的研究人员现在通过修改常用的Seq-Well技术，大大提高了从每个细胞收集的信息量。
单细胞测序找到背后原因
黑色素瘤是最为致命的皮肤癌类型，且发病率不低——根据美国癌症学会的统计，每38名白种人里，就有1人会在生命中的某一时刻罹患黑色素瘤。如果发现得早，这种恶性肿瘤还可以通过手术切除。一旦它发生扩散，治疗手段就会大受局限。但要早期发现黑色素瘤并非易事。在很多人的意识里，黑色素瘤来源于痣的恶化。然而事实上，这只能解释部分黑色素瘤的起源。大部分黑色素瘤在发
中国科学家首次解析神经母细胞瘤单细胞图
神经母细胞瘤（NB）是神经-衍生的恶性肿瘤的一种亚型，是儿童时期最常见的颅外实体瘤。尽管进行了广泛的研究，NB的潜在发展起源仍不清楚。2020年9月17日，复旦大学研究团队在Cancer Cell 在线发表题为“Glial Metabolic Rewiring Promotes Axon Regeneration and Functional R