独家专访中国学者《Nature》子刊发布最大规模肺癌T细胞单细胞免疫图谱
小编推荐:您不可错过的2018单细胞组学技术与应用研讨会2018年6月26日凌晨1:00,《Nature Medicine》发表迄今针对肿瘤相关T细胞的规模最大的单细胞组学研究,北大张泽民教授团队通过非小细胞肺癌12,346个T细胞的单细胞测序及分析,发现了可能的肺癌新靶点。图1: 肿瘤免疫细胞单细胞测序流程图,图片来自《Natur
Genome Res:科学家开发出能对单细胞进行大规模分析的新型工具—BigSCale
2018年6月11日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在国际杂志Genome Research上的研究报告中,来自西班牙的研究人员通过研究提出了一种复杂的计算机框架来分析单细胞的基因表达水平,这一技术可以扩展到对数百万个独立的细胞进行分析处理,这项研究中,研究人员首次开发了一种工具来分析诸如大规模的单细胞RNA序列数据库,这或能极大地扩展单细胞基因组学的研究范围。图片来源:xoomtr
《Cell》:单细胞组蛋白修饰模型展示表观遗传多样性随着衰老而增加
染色质修饰包括组蛋白转录后修饰,组蛋白多样性。连同DNA一起调控表观遗传表型。虽然染色质修饰在多种生理学过程和人类疾病中都有重要的意义,但是由于此前存在的技术检测通道有限,无法同时检测各种免疫细胞亚群特异性marker和各种染色质修饰。因此在人类免疫细胞中进行染色质研究具有挑战性。近期出现的一个技术突破——质谱流式技术,可以在少量细胞甚至是单细胞中进行四十种以上参数采集,可以完美应对这一挑战。斯坦
Science:大量肾脏单细胞的RNA测序分析阐明慢性肾脏疾病的发病根源
2018年4月9日 讯 /生物谷BIOON/ --肾脏是一个非常复杂的器官,其功能远远不止一个简单的“过滤器”,肾脏要正常发挥功能,需要多个高度特异性的不同细胞类型之间相互作用来帮助机体通过尿液排出废物、平衡体液,调节血压并且分泌多种激素。图片来源:Katalin Susztak, Perelman School of Medicine, University of Pennsylvania近日一
Cell:利用人工智能分析未经过荧光标记的细胞
小编推荐会议:2018年(第九届)细胞治疗国际研讨会2018年4月15日/生物谷BIOON/---经过荧光标记的细胞的显微照片无疑是漂亮的,但它们需要侵入性的有时是破坏性的或致命性的实验程序才能让它们发出荧光。在一项新的研究中,为了避免这种干扰,来自美国加州大学旧金山分校和谷歌公司的研究人员开发出一种计算机程序,它能够区分不同的细胞类型,并鉴定出亚细胞结构等特征---所有这一切都不需要我们的眼睛进
Nat Biotechnol:新型算法或能在单细胞分辨率下对多种数据进行有效整合
2018年4月4日 讯 /生物谷BIOON/ --最近,一项刊登在国际杂志Nature Biotechnology上的研究报告中,来自纽约大学的研究人员通过研究开发出了一种新型算法,其能在单细胞分辨率下多多种测序数据集进行排列,这种新方法未来或有望用来帮助理解不同群体的细胞如何在疾病进展过程中发生改变以及如何对药物疗法产生反应。图片来源:www.phys.org研究者Rahul Satija说道,
Nat Biotechnol:科学家开发出通量高于当前方法40倍的新技术 能同时对数千个细胞有效分析
2018年4月11日 讯 /生物谷BIOON/ --人类机体中有37万亿个细胞,然而将一种细胞与另外一种细胞进行区分的能力或许并不像我们想象中那么简单,近日,一项刊登在国际杂志Nature Biotechnology上的研究报告中,来自美国俄勒冈健康与科学大学(OHSU)的研究人员通过研究首次开发出了一种新方法,能够快速且有效地识别体内细胞的亚型,相关研究或能帮助研究人员在分子水平上理解多种人类疾
Nature:研究绘制出人脑前额叶发育的单细胞图谱
近日,中国科学院生物物理研究所王晓群课题组、北京大学未来基因诊断高精尖创新中心汤富酬课题组、北京大学第三医院乔杰课题组和首都医科大学附属安贞医院张军课题组合作,绘制出人脑前额叶胚胎发育过程的单细胞转录组图谱,并对其中关键的细胞类型进行了系统功能研究,为绘制完整的人脑细胞图谱奠定重要基础。相关研究成果以Single-cell RNA-Seq surveys a developmental lands
单细胞测序平民化,测一个细胞仅需一美分,一次能测上千个细胞!
2018年3月19日讯 /生物谷BIOON /——来自艾伦学院和华盛顿大学的科学家们开发出了一种廉价的高级技术可以检测成百上千个细胞的基因表达。这项基于配位的转录组测序技术(Split Pool Ligation-based Transcriptome sequencing,SPLiT-seq)是一项可延展的用于表征单个细胞RNA水平的技术,可用于鉴定脑部疾病及其他组织中的不同细胞类型,这项研究于
Cell:基于高通量单细胞转录组测序小鼠全细胞图谱发表
在国家自然科学基金项目(项目编号:31722027)等资助下,浙江大学医学院干细胞与再生医学中心郭国骥教授团队在单细胞组学技术及哺乳动物全细胞表达谱系分析研究中取得突破性进展。相关成果以“Mapping the Mouse Cell Atlas by Microwell-seq”(利用微孔板测序技术绘制小鼠细胞图谱)为题,于2018年2月23日在生命科学国际顶尖期刊Cell(《细胞》)